ved anvendelse af principperne for cost-benefit-analyse på virkelige verdensproblemer med ressourceallokering der skal udvises særlig omhu for at sikre, at den velfærdsøkonomiske teori, der ligger til grund for cost-benefit-teknikken, overholdes. Der opstår store problemer, hvor omkostninger og fordele bruges om hverandre til at repræsentere et programs gode og dårlige egenskaber. I nærværelse af gensidigt eksklusive projekter kan fokusering på nettofordelene (eller cost-benefit-forholdet) ved individuelle projekter i modsætning til nettofordelene ved brugen af budgetterede ressourcer føre til partiske skøn over projekternes skyggepris og følgelig fejl i analytikernes konklusioner. Som følge heraf er økonomiske vurderinger af individuelle projekter ikke direkte relevante for at vælge mellem gensidigt eksklusive projekter af forskellig størrelse. Begge typer problemer illustreres med henvisning til både enkle eksempler og offentliggjorte økonomiske vurderinger af sundhedsteknikker. Heltalsprogrammering foreslås og demonstreres som en metode til at vælge mellem gensidigt eksklusive projekter.
