Baker tiltrådte Ecolab i 1989 og havde oprindeligt forskellige marketing-og lederstillinger i USA og Europa, herunder vicepræsident og general manager for Kay Chemical Co. en afdeling af Ecolab, der leverer rengørings-og desinficeringsprogrammer, der er skræddersyet specielt til markederne for hurtig mad (fastfood) og mad detail (supermarked og købmand).
Baker blev derefter vicepræsident for Ecolabs institutionelle erhvervssektor, der leverer rengørings-og sanitetsprodukter, – programmer og-tjenester til Fødevareservice, gæstfrihed, sundhedspleje og erhvervskunder i Nordamerika.
Baker blev udnævnt til Ecolabs Præsident og administrerende direktør i 2002, Præsident og administrerende direktør i 2004 og tilføjede bestyrelsesformand i 2006. Fra 12/31/2013 til 12/31/2017 voksede Ecolabs salg fra 3,6 milliarder dollars til 14 milliarder dollars, en stigning på 268%, og aktionærens egenkapital steg 476%.
Baker har modtaget adskillige priser og anerkendelse gennem hele sin karriere. Senest blev han tildelt 2018 Deming Cup for operationel ekspertise. Han blev udnævnt til Forbes Global 2000: Hall of Fame administrerende direktører og udnævnt til Årets ansvarlige administrerende direktør i 2014 af magasinet Corporate Responsibility. Han blev også udnævnt til en af verdens bedste administrerende direktører af Harvard Business anmeldelse i 2016 (#41) og 2017 (#39) og blev optaget i Minnesota Business Hall of Fame i 2012.
før han kom til Ecolab, tilbragte Baker syv år med Procter & Gamble i forskellige brand management positioner.
ud over sit Ecolab-ansvar fungerer Baker som medlem af bestyrelsen for Target Corporation, som medlem af bestyrelsen for Mayo Clinic og som administrator emeritus for National Restaurant Association Educational Foundation. Han er tidligere medlem af bestyrelsen for US Bancorp og tidligere medlem af bestyrelsen for tilsynsmænd ved University of Minnesota. Han tjener også i bestyrelsen for College of the Holy Cross, hans alma mater.
