Mission Mountains består stort set af det, der kaldes “Bæltesten” fra Bæltsupergruppen. De sedimentære klipper i denne gruppe dannede sig mellem 1, 47 og 1, 4 milliarder år siden i Bæltebassinet. Det groft cirkulære bassin indsamlede sedimenter fra de omkringliggende områder i millioner af år. Bassinet blev til sidst begravet og senere geneksponeret gennem kollisionen af flere tektoniske plader omkring 80 for millioner år siden.
meget af Bæltesten, der findes i Mission Mountains, er en smuldrende sedimentær klippe kendt som mudstone. Mudstenen i Bæltsupergruppen er ofte kendetegnet ved mudrevner, hvilket peger på, at den dannes under våd, tørring, revner og derefter gentagne gange oversvømmes med nyt vådt materiale, der også tørres og revnes.
det meste af klippen i Missionsbjergene kommer fra slutningen af den Proterosoiske Eon, mod slutningen af det, der kaldes prækambrisk tid. Fordi de er så gamle, er det eneste bevis på liv i klipperne algerblomstringer og meget basale plantefossiler. Disse organismer spillede imidlertid den vigtige rolle at omdanne kulsyre i vandet til ilt, der blev pumpet ind i den sure og dårligt iltede atmosfære.
mudstenens farve i missionerne har meget at gøre med tilstedeværelsen af mineralsk hæmatit under dens dannelse. Hæmatit dannes af jernpartiklernes reaktion på ilt i atmosfæren. Grønne og grå sten fundet i missionerne blev sandsynligvis dannet i dybt vand, det røde i mere lavt vand. Ripple mærker kan findes i meget af klippen; de ville have dannet sig mest i lavt vand med blide bølger.
Løftrediger
funktionerne i Mission Mountains afspejler stærkt arbejdet i de sidste par istider, den seneste af dem er lidt over 10.000 år siden. Men sortimentet er også et produkt af en meget længere historie, en der kan startes med opbruddet af Pangea-superkontinentet. Da kontinenterne begyndte at sprede sig, kom den Nordamerikanske Plade vestpå og slibede over og mod Stillehavspladen, mens den gik. Denne subduktion af Stillehavspladen forårsagede stigningen i Rocky Mountains og dermed missionerne.
for omkring 66 millioner år siden begyndte denne opløftningsproces at aftage. Denne gang, kaldet den Cenosoiske æra, er da området begyndte at se meget ud som det gør i dag. Når man ser på kloden på det tidspunkt, ville kontinenterne have handlet om, hvor de er i dag, og plante-og dyreliv ville være genkendeligt. På det tidspunkt ville de dybe dale i det vestlige Montana imidlertid endnu ikke have dannet sig.
denne udvikling menes at være kommet for omkring 40 millioner år siden, da de ekstensionskræfter, der forårsagede hævningen af Rockies, begyndte at få skorpen til at tynde og knække. Næsten lodrette fejl dannede sig næsten ensartet i hele regionen, mest trendende nordvest til sydøst. Blokkene brød derefter op, nogle faldt og skabte Dale som Flathead og Svanen. I alt tog hele processen omkring 100 millioner år.
Pleistocæn glaciationredit
for tre millioner år siden, i slutningen af den Cenosoiske æra, ville vestlige Montana have været fuld af høje bjerge, men det var den næste geologiske proces, der gjorde dem til det, de er i dag. Store gletsjere begyndte at danne sig i området for 2-3 millioner år siden; dette var begyndelsen på Pleistocæn-epoken. Siden da, der sluttede for kun 10.000 år siden, er Missionsbjergene og deres omgivelser blevet formet af vand.
dannelsen af Flathead Lobe af Alberta Cordilleran ice sheet er det, der satte denne historie i bevægelse. På sine tykkeste punkter kan Flathead Lobe glacier have strakt sig 4.000 fod over dalbunden. Gletsjeren nåede hundreder af miles ned ad Rocky Mountain Trench og sluttede så langt syd som St. Ignatius, Montana. I den nordlige ende af området splittede gletscherstrømmen, delvis strømmer langsomt ind i Svanedalen.
en visning af området på det tidspunkt ville have været majestætisk med store gletsjere, der flyder rundt om begge sider og delvist over området. Mindre gletsjere ville også have strømmet ud af bjergene og sluttede sig til den større i dalen. Dette forklarer de sydspidsede, krogformede kamme i slutningen af hver kløft i området.
disse processer gav også Missionsbjergene deres forskellige former. De mange tresidede toppe, kaldet horn eller pyramidetoppe, og de knivlignende kamme i den sydlige halvdel af området er resultater af den tunge bjergglaciering. Den nordlige halvdel af området blev stort set rullet over af Flathead Lobe, som var meget som en enorm bevægende indlandsis. Dette førte til de kortere, mere afrundede træk i den nordlige halvdel af området.
Pleistocænen var en tid med dramatisk og hurtig skulptur i Missionsbjergene. Og selvom denne epoke er afsluttet, fortsætter erosionen. Regn, sne, is, vind og andre kræfter fortsætter med at arbejde på missionernes alpine landskab.