Baker kam 1989 zu Ecolab und bekleidete zunächst verschiedene Marketing- und Führungspositionen in den USA und Europa, darunter Vice President und General Manager von Kay Chemical Co. eine Abteilung von Ecolab, die Reinigungs- und Desinfektionsprogramme anbietet, die speziell auf die Märkte Quick Food Service (Fast Food) und Food Retail (Supermarkt und Lebensmittelgeschäft) zugeschnitten sind.
Baker wurde dann Vice President des Institutional Business Sector von Ecolab, der Reinigungs- und Sanitärprodukte, -programme und -dienstleistungen für Kunden aus den Bereichen Food Service, Hospitality, Healthcare und Commercial in Nordamerika anbietet.
Baker wurde 2002 zum President und Chief Operating Officer von Ecolab ernannt, 2004 zum President und Chief Executive Officer und 2006 zum Chairman of the Board. Vom 31.12.2013 bis zum 31.12.2017 stieg der Umsatz von Ecolab von 3,6 Milliarden US-Dollar auf 14 Milliarden US-Dollar, was einer Steigerung von 268% entspricht, und das Eigenkapital stieg um 476%.
Baker hat im Laufe seiner Karriere zahlreiche Auszeichnungen und Anerkennungen erhalten. Zuletzt wurde er mit dem Deming Cup 2018 für Operational Excellence ausgezeichnet. Er wurde in die Forbes Global 2000: Hall of Fame CEOs aufgenommen und vom Corporate Responsibility Magazine zum Responsible CEO des Jahres 2014 ernannt. Er wurde auch von der Harvard Business Review in den Jahren 2016 (# 41) und 2017 (# 39) zu einem der weltweit besten CEOs ernannt und 2012 in die Minnesota Business Hall of Fame aufgenommen.
Bevor Baker zu Ecolab kam, war er sieben Jahre bei Procter & Gamble & in verschiedenen Positionen im Markenmanagement tätig.
Zusätzlich zu seinen Ecolab-Aufgaben ist Baker Mitglied des Board of Directors der Target Corporation, Mitglied des Board of Trustees der Mayo Clinic und emeritierter Treuhänder der National Restaurant Association Educational Foundation. Er ist ehemaliges Mitglied des Board of Directors von U.S. Bancorp und ehemaliges Mitglied des Board of Overseers an der University of Minnesota. Er ist auch Mitglied des Kuratoriums des College of the Holy Cross, seiner Alma Mater.
