Bereits im Jahr 782 begann der Verkauf von Fisch in der Gegend, dank des kalten Grundwassers, das auf dem Gelände verfügbar war und es ermöglichte, Fisch und anderes Fleisch in der Nähe des Kaiserpalastes von Kyoto frisch zu halten.
Im Jahr 1615 erhielt der Ort zum ersten Mal offiziell die offizielle Erlaubnis der Bakufu-Regierung, den Fischverkauf durchzuführen, was der erste Schritt war, um ein renommierter Markt zu werden, der er heute ist.
1883, nach der Meiji-Restauration, wurde die Anzahl der Geschäfte aufgrund des starken Wettbewerbs zwischen den Betrieben auf nur noch 7 reduziert.
1911 ein neuer Verein, der den Markt als Ort für den Verkauf von Fisch und Meeresfrüchten fördert Infolgedessen erlebte der Markt eine neue Vitalität.
1927 wurde der zentrale Großmarkt von Kyoto eröffnet und viele Geschäfte zogen vom Nishiki-Markt dorthin.
1928 förderte ein neuer Verein die Eröffnung von Geschäften mit Obst, Gemüse, Fleisch und anderen Lebensmitteln. Dies markiert den Punkt, an dem der Markt als „Kyotos Küche“ bekannt wurde.
1984 wurde der derzeitige Kopfsteinpflasterboden und 1993 das derzeitige Arkadendach installiert.
Im Jahr 2005 wurde „Nishiki Market“ als Marke eingetragen.
