Baker se unió a Ecolab en 1989, ocupando inicialmente varios puestos de marketing y liderazgo en los Estados Unidos y Europa, incluido el vicepresidente y gerente general de Kay Chemical Co. una división de Ecolab que ofrece programas de limpieza y desinfección diseñados específicamente para los mercados de servicio de comida rápida (comida rápida) y venta minorista de alimentos (supermercados y supermercados).
Baker se convirtió en vicepresidente del sector empresarial institucional de Ecolab, que proporciona productos, programas y servicios de limpieza y saneamiento a clientes de servicios de alimentos, hotelería, atención médica y comerciales en América del Norte.
Baker fue nombrado presidente y director de operaciones de Ecolab en 2002, presidente y director ejecutivo en 2004 y se añadió presidente de la junta directiva en 2006. Del 31/12/2013 al 31/12/2017, las ventas de Ecolab crecieron de $3.6 mil millones a 1 14 mil millones, un aumento del 268%, y el capital de los accionistas aumentó un 476%.
Baker ha recibido numerosos premios y reconocimientos a lo largo de su carrera. Más recientemente, fue galardonado con la Copa Deming 2018 por Excelencia Operativa. Fue nombrado CEO del Salón de la Fama de Forbes Global 2000 y nombrado CEO Responsable del Año en 2014 por la revista Corporate Responsibility. También fue nombrado uno de los mejores directores ejecutivos del mundo por Harvard Business Review en 2016 (#41) y 2017 (#39) y fue incluido en el Salón de la Fama de Negocios de Minnesota en 2012.
Antes de unirse a Ecolab, Baker pasó siete años con Procter & Gamble en varios puestos de gestión de marca.
Además de sus responsabilidades en Ecolab, Baker se desempeña como miembro de la junta directiva de Target Corporation, como miembro de la junta directiva de Mayo Clinic y como fideicomisario emérito de la Fundación Educativa de la Asociación Nacional de Restaurantes. Es ex miembro de la junta directiva de U. S. Bancorp y ex miembro de la junta de supervisores de la Universidad de Minnesota. También es miembro de la junta directiva del Colegio de la Santa Cruz, su alma mater.