Los problemas entre Cuáqueros y Puritanos comenzaron mucho antes del traslado a América del Norte, con los mismos problemas que surgieron en las disputas tanto en la vieja y Nueva Inglaterra.
Los ministros puritanos asistían activamente a sermones y reuniones cuáqueras e intentaban iniciar debates y atacar a la gente por sus puntos de vista en los espacios creados para que esos puntos de vista se expresaran. Veían a los cuáqueros como una interrupción de su ortodoxia, y debido a las diferencias extremas entre las prácticas (con los puritanos atados estrechamente a la iglesia, y los cuáqueros creyendo que el espíritu está dentro de la persona y que no necesitan una iglesia para adorar) veían a los cuáqueros más cercanos a la brujería que a una religión cristiana.
Los puritanos creían que si no tenían el control de su comunidad, entonces no estaban cumpliendo con su vocación religiosa, y tenían que eliminar las creencias en cualquier punto de vista opuesto.
Los cuáqueros también eran relativamente vocales y buscaban activamente nuevos miembros y su movimiento creció bastante rápidamente. Esto causó conflictos públicos y batallas legales. George Fox, su esposa, Margaret Fell, y William Penn, fueron encarcelados y multados en varios momentos de su vida por predicar y practicar su religión. Estaban lejos de ser los únicos: en la Inglaterra puritana, entre 3.000 y 4.000 cuáqueros fueron multados o encarcelados y 338 murieron en prisiones inglesas.
