¿Nombrar un nuevo gen? Es una buena idea verificar en el proyecto genoma de pombe del Centro Sanger para ver si la designación de su gen ya está tomada. También puede reservar un nombre genético para un locus en particular antes de la publicación. Se insta a los investigadores a utilizar el registro de genes para reservar nombres, proponer cambios de nombres o ponerse en contacto con el GNC (comité de nomenclatura genética). El GNC abordará nombres duplicados, designaciones no estándar y otros asuntos similares. También revisará las normas de nomenclatura según sea necesario para garantizar que estén actualizadas. Acceda al comité a través del sitio anterior.
Reglas generales de nomenclatura: Los nombres de genes de levadura de fisión generalmente se expresan como tres letras, nombre en cursiva seguido de un número y un plus para el tipo salvaje (cdc19+; el plus debe estar superíndice en texto normal). En mutantes, el plus es reemplazado por una designación alélica (cdc19-P1). Las denominaciones de los alelos varían ampliamente en formato; algunos son letras, algunos números, algunos una mezcla.
La mayoría de los investigadores indican eliminaciones con un Δ (delta). Por ejemplo, una interrupción de su gen favorito yfg1+ con ura4+ se escribe Δyfg1:: ura4+ en una tabla de deformación adecuada, aunque las personas a menudo usan Δ yfg1 o yfg1Δ como texto corto. Recientemente, yfg1Δ se ha convertido en la designación preferida. Para alelos de deleción construidos sin inserción, algunos usan una designación de alelo que comienza con D; por ejemplo, ura4-D18 es una deleción de ura4+. Sin embargo, no puede estar seguro de que una «D» en una designación de alelo sea siempre una deleción, así que tenga cuidado y lea la literatura. Algunos recomiendan encarecidamente que los alelos de eliminación reciban una designación alélica única, por ejemplo, yfg1-D1::ura4+, pero esto no es típico. Sin embargo, en varios casos, el mismo gen se ha alterado en diferentes laboratorios, y los fenotipos varían de acuerdo con la construcción precisa. Sin un identificador único para el alelo de un laboratorio dado, esto ha llevado a una confusión considerable en la literatura.
El:: (doble colon) se utiliza para indicar una inserción en el genoma. No es necesario que corresponda a una eliminación/interrupción, por ejemplo, marcar un lugar geométrico integrando un marcador aguas abajo se indicaría yfg1+::leu1+ o yfg1+::pAB123. Generalmente, lo que viene antes de:: es el locus, y necesitas indicar si es de tipo salvaje o mutante; lo que viene después de :: es lo que se integró, y también necesitas identificarlo. En algunos casos, las personas usan un solo colon: para indicar una inserción, y un doble colon :: para indicar un reemplazo/interrupción.
Las proteínas se indican con texto romano. En la literatura antigua, esto fue seguido por una p adjunta (por ejemplo, Cdc19p). La p es particularmente útil para personas sin levadura que podrían no estar familiarizadas con las convenciones del tipo romano versus el itálico, pero ha caído en desgracia. Para complicar aún más la vida, la nomenclatura de la levadura en ciernes es diferente: los nombres de genes de tipo salvaje están en mayúsculas cursivas (LEU2), los mutantes (a menos que sean dominantes) están en minúsculas (leu2-3) y los nombres de proteínas están en texto romano (LEU2 o Leu2).
