Dès l’année 782, la vente de poisson a commencé dans la région, grâce aux eaux souterraines froides disponibles sur le site, ce qui a permis de conserver les poissons et autres viandes frais dans un endroit proche du Palais impérial de Kyoto.
En 1615, pour la première fois, l’endroit a reçu officiellement l’autorisation officielle du gouvernement du Bakufu de procéder à la vente de poisson, étant la première étape pour devenir un marché renommé qu’il est aujourd’hui.
En 1883, après la restauration de Meiji, en raison de la forte concurrence entre établissements, le nombre de magasins a été réduit à seulement 7.
En 1911, une nouvelle association promouvant le marché comme lieu de vente de poissons et de fruits de mer en conséquence, le marché a connu une vitalité renouvelée.
En 1927, le Marché de gros central de Kyoto a ouvert et de nombreux magasins y ont déménagé du marché de Nishiki.
En 1928, une nouvelle association favorise l’ouverture de magasins proposant fruits, légumes, viandes et autres produits alimentaires. Cela marque le point d’où le marché a commencé à être connu sous le nom de « cuisine de Kyoto ».
En 1984, le sol pavé actuel a été installé et en 1993, la verrière actuelle de l’arcade a été installée.
En 2005, « Nishiki Market » a été enregistré en tant que marque.
