- előlegek genomikai tesztelés-mit kell tudni
- Dr. C. H. Weaver M. D. frissítve 9/1/2018
- áttekintés
- háttér—alapelvei genetika
- A genetikai rendellenességek típusai a következők:
- tesztek a genetikai rendellenességek kimutatására
- fluoreszcencia in situ hibridizáció (Fish)
- polimeráz láncreakció (PCR)
- reverz transzkripciós PCR
- stratégiák a genetikai rendellenességek kimutatásának javítására
előlegek genomikai tesztelés-mit kell tudni
Dr. C. H. Weaver M. D. frissítve 9/1/2018
K: Mi genomikai tesztelés?
A: a genomikai tesztelés a gének egy csoportját és azok különböző expressziós szintjét vizsgálja. Ez a génexpresszió vagy aktivitás jellemzi, hogy a gének kölcsönhatásba lépnek egymással, és megjósolják bizonyos szövetek viselkedését a testben. Ez ellentétben áll a genetikai teszteléssel, amely egy adott kromoszómán vagy génen belüli specifikus változást vizsgál, gyakran egy örökölhető tulajdonság részeként.
K: Milyen szerepet játszik a genomikai tesztelés a rák diagnózisában?
A: a genomikai vizsgálatok információt nyújthatnak a beteg prognózisáról az egyén rákos szövetében lévő génexpresszió alapján, és gyakran megjósolhatják, hogy bizonyos terápia (például kemoterápia) előnyös lesz-e.
k: a diagnosztikai folyamat mely pontján történik a genomikai vizsgálat?
A: A genomikai vizsgálat bármikor megtörténhet a rák szövetmintájának (biopszia vagy reszekció) megszerzése után.
K. milyen kérdéseket kell feltennem az egészségügyi csapatomnak a genomikai vizsgálatokkal kapcsolatban?
A: az alábbiakban az elsődleges kérdéseket kell feltenni az egészségügyi szolgáltatónak.
- rendelkezésre áll-e genomikai vizsgálat a rák típusára, hogy segítsen meghatározni az Általános prognózisomat?
- a vizsgálat eredményei megváltoztathatják a rák kezelését? Konkrétan:
- meg tudja-e mondani a teszt, hogy bizonyos terápiák hasznosak lesznek-e a kezelésemben?
- volt-e pozitív eredménye annak, hogy ezt a tesztet más betegekkel alkalmazta?
- ezt a tesztet fedezi a biztosítási tervem? (Ez a fajta tesztelés több ezer dollárban futhat, bár sok terv fedezi a teszteket anélkül, hogy zsebköltséget jelentene.)
k: vannak olyan specifikus ráktípusok, amelyeknél a genomikai tesztelés szerepe különösen jelentős?
A: A rákos betegeknek három típusa van, akik számára a genomikai tesztelés különösen előnyös lehet:
- azoknál az ösztrogénreceptor-pozitív emlőrákban szenvedő betegeknél, akik még nem terjedtek el a nyirokcsomókban (korai stádiumú emlőrák), prognózisuk lehet, amelyet önmagában szöveti biopsziával nehéz megjósolni. A genomikai tesztelés nemcsak a prognosztikai információk biztosításában segíthet (azaz előre jelzett 10 éves túlélés), hanem azt is megjósolhatja, hogy a kemoterápia jelentős előnyökkel jár-e, lehetővé téve a beteg számára, hogy elkerülje a kemoterápia toxicitását, ha lehetséges.
- bizonyos típusú vastagbélrákban szenvedő betegek szintén részesülhetnek a genomikai vizsgálatokból a prognózis meghatározása, a kemoterápia előnyeinek előrejelzése és a kemoterápia kiválasztása szempontjából (annak meghatározása, hogy mely vegyi anyagok lesznek a leginkább előnyösek).
- azok a betegek, akiknek a rákja átterjedt a test más helyeire (metasztatikus betegség), vagy amelyek lokálisan kiújultak (a műtét és/vagy a kemoterápia ellenére), genomikai vizsgálaton eshetnek át, amely a gének széles skáláján vizsgálja az expressziót, beleértve azokat is, amelyek általában nem kapcsolódnak a rák eredeti helyéhez. Ez a fajta genomikai vizsgálat azonosíthat bizonyos géneket, amelyek potenciálisan a terápia célpontjai lehetnek, amelyeket eredetileg nem vettek figyelembe. A célzott terápia megváltoztatása jelentősen javíthatja a túlélést.
a genomika feltörekvő szerepe a rák diagnosztizálásában és monitorozásában
áttekintés
a rák olyan genetikai rendellenességek eredménye, amelyek befolyásolják bizonyos gének működését. A gének határozzák meg a sejtek formáját, működését és növekedési mintáit. Azok, amelyek felgyorsítják vagy elnyomják a növekedést, gyakran részt vesznek a rákban. Például sok ráknak rendellenessége van egy olyan génben, amely felelős a sejtnövekedés stimulálásáért és/vagy a gén, amely általában megakadályozza a rákot, nem működik megfelelően. Mindkét genetikai rendellenesség kontrollálatlan és túlzott sejtnövekedést eredményezhet, ami a rák jellemzője. A genomikai tesztek vagy a tudósok által nevezett vizsgálatok egy eszköz a rák specifikus génjeinek azonosítására, amelyek abnormálisak vagy nem működnek megfelelően. Lényegében ez olyan, mint egy adott rák genetikai aláírásának vagy ujjlenyomatának azonosítása.
a genomikai tesztelés különbözik a genetikai teszteléstől. A genetikai teszteket általában annak meghatározására használják, hogy az egészséges egyénnek van-e öröklött vonása (génje), amely hajlamosítja őket a rák kialakulására. A genomikai tesztek a beteg szövet mintájában lévő géneket értékelik egy olyan betegtől, akit már diagnosztizáltak rákkal. Ily módon azonosítják azokat a géneket, amelyek mutálódtak vagy rendellenes funkciókat fejlesztettek ki, azon kívül, amelyek esetleg öröklődtek.
a genomikai vizsgálatok segíthetnek az orvosoknak:
- határozza meg a beteg prognózisát (potenciális kimenetelét)
- határozza meg, hogy a rák agresszív/gyorsan vagy lassan növekszik-e
- válassza ki az egyes rákok számára a leghatékonyabb kezelést
- monitorozza a kezelés alatt álló betegeket annak megállapítása érdekében, hogy a kezelés működik-e
- monitorozza azokat a betegeket, akik remisszióban vannak, hogy korán elkapják a betegség lehetséges progresszióját, amikor az kezelhető
a genomikai tesztelés talán legnagyobb ígérete a kezelés individualizálásának lehetősége. Ez azt jelenti, hogy a súlyosabb állapotú betegek azonosíthatók és agresszív és innovatív terápiákat kínálhatnak, amelyek meghosszabbíthatják életüket, míg a kevésbé súlyos állapotú betegek megkímélhetik a felesleges kezeléseket. Például néhány csomópont-negatív emlőrákban szenvedő nő visszaesik, miután csak műtéttel kezelték őket. A genomikai vizsgálatok kimutatták, hogy különbséget tesznek a között, hogy mely node-negatív emlőrákos betegek nagyobb valószínűséggel relapszusosak, és ezért előnyösek a további kemoterápiában, és mely betegeknek nincs szükségük kemoterápiára.
ahhoz, hogy megértsük, hogyan alkalmazzák a genetika tudományát a rák diagnosztizálására és monitorozására, hasznos megérteni a genetika alapelveit. Ez magában foglalja annak ismeretét, hogy mi a DNS, a kromoszómák és a gének, hogyan működnek, és hogyan alakul át a DNS-ben található információ a génexpresszió révén olyan specifikus struktúrákká, amelyek diktálják a sejt funkcióit.
ezzel a háttérismerettel meg lehet érteni a genetikai rendellenességek kimutatására szolgáló tesztek ígéretét, például:
- fluoreszcencia in situ hibridizáció (FISH)
- polimeráz láncreakció (PCR)
- fordított transzkripciós PCR
- mikroarray technológia
- szérum proteomika
háttér—alapelvei genetika
a genetika fontossága az öröklődésben jól ismert, azonban a genetika szerepe a sejtek szerkezetének és működésének szabályozásában még kritikusabb lehet az egyes organizmusok számára. Az öröklődés biztosítja, hogy az emberek és minden faj képes reprodukálni és fenntartani egyedi vonásait, és irányítja a sejtek felépítését, milyen munkát végeznek, és hogyan nőnek annak biztosításához, hogy egy szervezet túlélje a szaporodást. A DNS és a gének kritikus szerepének megértése a sejt percenkénti életének meghatározásában szintén fontos annak megértéséhez, hogy a genetika hogyan vesz részt a rákban.
DNS: az egész szervezet genetikai információja minden sejt magjában megtalálható dezoxiribonukleinsav, közismert nevén DNS formájában. A DNS egy kettős szálú spirális (tekercselt) molekula. Minden szál szerkezeti gerincből áll, plusz nitrogéntartalmú vegyületek sorozatából, az úgynevezett nitrogénbázisokból, amelyek a genetika ábécéjének tekinthetők. Négy bázis van: adenin, guanin, timin és citozin. A két szál az alapoknál van összekötve.
a genetikai kód, vagy a sejt szerkezetét és működését szabályozó genetikai információ a bázisok sorrendjében található. Az alapszekvencia végül szabályozza az aminosavak szekvenciáját, amelyek összekapcsolódnak egy fehérjemolekula előállításához. A különböző szekvenciák különböző fehérjéket alkotnak. A sejtben szintetizált fehérjék meghatározzák a sejt szerkezetét és működését.
kromoszómák: a DNS meghatározott számú egységbe van csomagolva, úgynevezett kromoszómák. Az embereknek 46 kromoszóma van minden sejtben. A kromoszómák legtöbbször szorosan a sejtmagban lévő fehérjék köré vannak csomagolva, így nem láthatók. A sejt életének közvetlenül a sejtosztódás előtti szakaszaiban azonban a kromoszómák fénymikroszkóppal láthatóvá válnak. Úgy tűnnek, mint egy nagy “H”, négy hosszúságú tekercselt DNS-sel, amelyet egy fehérje csatlakoztat a “H” “keresztjeként”.
gének: a DNS génekbe szerveződik, amelyek a DNS hosszú szegmensei, amelyek olyan régiókat tartalmaznak, amelyek exonoknak nevezett fehérjék kódjait tartalmazzák, valamint az intronoknak nevezett nem kódoló régiókat. A géneket az öröklődés alapvető egységeként definiálják, mivel az utódoknak átadják, majd a sejtosztódás során reprodukálják és továbbítják az egyes sejteknek. A replikáció magában foglalja a DNS mindkét szálának sablonként történő felhasználását az ingyenes DNS (cDNS) szintetizálására, amely egy megfelelő szál. Az eredmény két azonos DNS-kópia minden sejtre, miután a sejtosztódás befejeződött. Normál körülmények között a DNS és így a gének szerkezete viszonylag állandó marad a replikáció és a sejtosztódás révén.
génexpresszió: a génekben található genetikai információ a génexpressziónak nevezett folyamat révén átalakul a sejtek szerkezetébe és működésébe. A géneket kódoknak vagy recepteknek lehet tekinteni a fehérjék előállításához. A fehérjék a sejtek szerkezetének és működésének alapvető összetevői. Amikor egy gén “expresszálódik”, az általa kódolt fehérje vagy fehérjék aktívan beépülnek a sejtbe, és az a funkció, amelyet ezek a fehérjék szolgálnak, végrehajtják. Például, amikor a HER-2/neu gént emlőrákban expresszálják, több epidermális növekedési faktor receptor (EGFRs) van jelen, amelyek fehérjék a sejtfelszínen, amelyet a HER-2/neu kódol. Továbbá az EGFR funkciója a sejtnövekedés serkentése; tehát egy HER-2/neu-t expresszáló sejtnek sok EGFR-je van, és aktívan növekszik.
a génexpresszió egy komplex rendszeren keresztül történik, amely a következő lépéseket foglalja magában:
- a DNS-molekula két szálának ideiglenes elválasztása egy adott génnél.
- a DNS szegmensének transzkripciója, amely a kitett DNS-szekvencia egyszálú másolatának szintézise; ezt a másolatot messenger RNS-nek (mRNS) nevezzük.
- fehérjeszintézis, vagy új fehérjék építése a sejtben, az mRNS-ben található információk alapján.
genetikai rendellenességek: A genetikai rendellenességek a sejt DNS-jének olyan változásai, amelyek véletlenül vagy környezeti hatás miatt fordulhatnak elő. Ezek a változások bizonyos előnyöket kölcsönöznek az érintett sejtnek a normál sejtekkel szemben, ami elősegíti a növekedést. Ennek eredményeként a sejt képes gyorsan osztódni, rákos növekedéssé válik. Ez a növekedési előny azonban csak az egyes sejtek számára előnyös, nem feltétlenül az egész szervezet (ember) számára.
A genetikai rendellenességek típusai a következők:
transzlokációk—egy gén változó helyei az egyik kromoszómából egy másik kromoszómán lévő génnel; ez a fajta rendellenesség meghatározza a sokféle leukémiát
deléciók—hiányzik egy gén vagy nukleotidszekvencia a DNS—ben
polimorfizmusok-a nukleotidszekvencia variációi
tesztek a genetikai rendellenességek kimutatására
számos új laboratóriumi vizsgálat képes kimutatni a genetikai rendellenességeket. A betegséget okozó mutáció megtalálása egy génben megerősítheti a rák feltételezett diagnózisát, vagy azonosíthatja azokat, akik hajlamosak bizonyos rákokra. Néhány ilyen technika, amelyet jelenleg a klinikai környezetben alkalmaznak, a következők:
- fluoreszcencia in situ hibridizáció (Fish)
- polimeráz láncreakció (PCR)
- reverz transzkripciós PCR
ezenkívül a következő laboratóriumi technikákat alkalmazzák a rákkutatásban, amelyek a jövőben klinikai felhasználásra is rendelkezésre állhatnak:
- Microarray
fluoreszcencia in situ hibridizáció (Fish)
a FISH egy laboratóriumi technika, amelyet genetikai rendellenességek kimutatására használnak az egysejtű és az egyetlen gén szintjén, mint például a numerikus rendellenességek (nukleotidok nyeresége és vesztesége) és a transzlokációk (egy gén vagy génszegmens változó helye az egyik kromoszómán génnel vagy egy szegmenssel egy másik kromoszómán). Ezek a rendellenességek szerepet játszanak egyes rákos megbetegedések, például leukémiák és lymphomák kialakulásában és progressziójában1.
hogyan működik a hal? A halakat olyan mintasejteken hajtják végre, amelyek DNS-je kibontakozott, hogy az egyes kromoszómák láthatók legyenek. Ez a sejtfázisok során történik, közvetlenül a sejtosztódás előtt, metafázisnak vagy interfázisnak nevezik. A minta DNS-ét először hővel és kémiai formamiddal denaturáljuk úgy, hogy az egyes szálak elváljanak, felfedve az alapszekvenciát. Ezután specifikus DNS-szekvenciákat, úgynevezett próbákat, amelyek a színes fluorokhoz kapcsolódnak, inkubáljuk vagy kombináljuk a minta DNS-ével. A szondák hibridizálódnak (összekapcsolódnak) a kromoszómákban lévő DNS-sel, amely a szonda alapszekvenciájának bókja. A hibridizált DNS-ből és a szondából származó fluoreszcencia jelenléte vagy hiánya speciális mikroszkóppal látható, és jelzi, hogy a kérdéses DNS-szekvencia jelen van-e a mintában. Ezenkívül speciális HALTECHNIKÁKAT lehet használni a rákban részt vevő transzlokációk, inverziók és amplifikációk kimutatására.2
hal emlő-és petefészekrákban: a FISH gyakori használata annak meghatározására, hogy az emlő-és petefészekrákban szenvedő betegek túlexpresszálják-e a HER2/neu onkogént, egy olyan gént, amely gyakran részt vesz a rákban. A HER2 / neu hordozza a HER2 receptor genetikai kódját, amely fehérje egyes rákos sejtek felszínén található. A HER2 kötődik a vér növekedési faktoraihoz, ezáltal stimulálja a rákos sejtek növekedését.
a HER2/neu az emlő-és ovariumrák körülbelül 20-30% – ában amplifikálódik, és ez az amplifikáció és/vagy túlzott expresszió rossz prognózist jelez.3 a halak felhasználhatók annak megfigyelésére, hogy a HER2/neu onkogén több jelet küld-e az egyes sejtek szintjén, ami a gén amplifikációját jelzi.
hal hematológiai (vér) rákban: A halakat különböző hematológiai rosszindulatú daganatok diagnosztizálására és kezelésére is fel lehet használni. A sok hematológiai rosszindulatú daganat alapjául szolgáló genetikai rendellenesség a kromoszómális transzlokáció, vagy az egyik kromoszómából származó gén változó helye egy másik kromoszómán lévő génnel.
polimeráz láncreakció (PCR)
a PCR egy in vitro laboratóriumi módszer, amely hasznos a betegség genetikai vizsgálatához és a minimális reziduális betegség kimutatásához, amely a kezelés után maradt kis mennyiségű betegség, amely visszatéréshez vezethet, és más technikákkal általában nem mutatható ki. Ez az eljárás felerősíti a DNS egy szegmensét egy kis mintából, kimutathatóvá téve azt. PCR-rel az ismert DNS viszonylag kis szekvenciái rövid idő alatt több millió példányban replikálhatók.
hogyan működik a PCR? Ez a módszer négy fő komponenst igényel: 1) A minta DNS, 2) bőséges nukleotidellátás, 3) egy hőstabil polimeráz enzim, amely felelős a DNS másolásáért, és 4) primerek, rövid nukleotidszekvencia, amely a kérdéses DNS-fragmens mindkét oldalán fekszik, és jelzi a polimerázt, hogy megkezdje a specifikus DNS-szegmens replikációját.
a PCR egy háromlépcsős folyamat, mindegyik eltérő hőmérsékleten történik. A minta DNS-t először körülbelül 90-re melegítjük 6 párosított DNS-szál elválasztása érdekében. Miután elválasztottuk, olyan hőmérsékletre hűtjük, amely lehetővé teszi a primerek számára, hogy hibridizálódjanak a cél DNS-en lévő komplementer szekvenciájukkal, körülbelül 40-rel. Végül a DNS-replikáció körülbelül 70-nél következik be kb KB, az a hőmérséklet, amelyen a DNS-polimeráz a legaktívabb. Ezt a folyamatot 20-30-szor megismételjük, ami a kérdéses DNS-fragmens körülbelül 1 millió-szoros amplifikációját eredményezi.4
reverz transzkripciós PCR
reverz transzkripció (RT)-a PCR olyan technika, amely kimutatja a gének expressziójának mértékét. A bonyolult folyamatok szabályozzák, hogy a DNS melyik szegmense válik szét, átíródik (lemásolódik) mRNS-be, majd fehérjékként expresszálódik a sejtben. Nem minden gén átíródik, majd egyenlően expresszálódik. A sejtben lévő sok kontroll miatt egyes gének túlzottan expresszálódnak, ami azt jelenti, hogy a normálnál nagyobb sebességgel átíródnak és expresszálódnak, míg más gének most expresszálódnak, vagy “kikapcsolnak”, így bizonyos funkciók nem nyilvánulnak meg a sejtben.
hogyan működik az RT-PCR? Az RT-PCR ugyanazokat a lépéseket használja, mint a PCR a DNS egy szegmensének amplifikálására, de a minta az mRNS kiegészítő másolata. Az mRNS-sel kezdve ez a teszt csak az expresszált DNS-t méri, lehetővé téve annak meghatározását, hogy bizonyos gének milyen mértékben expresszálódnak. A klinikai onkológiában az RT-PCR legújabb alkalmazásai közé tartozik a nyirokcsomó mikrometasztázisok kimutatása prosztatarákban és csontáttétek emlőrákban.5
RT-PCR emlőrákban: a mellrák teszt Onkotípusa DX a xhamsternél RT-PCR-t alkalmaznak a kiújulás egyedi kockázatának meghatározására node-negatív ösztrogénreceptor (ER) – pozitív emlőrákban szenvedő nőknél. Ez a teszt 21 gén expresszióját értékeli az emlőrákban. Ezen gének némelyikének túlzott expressziója rosszabb prognózist jelez, míg mások expressziója jobb prognózist jelezhet. Mind a 21 gén expresszióját használják a “Megismétlődési pontszám ( = = )) kiszámításához, vagy annak valószínűségére, hogy a rák kiújul. Egy nagy klinikai vizsgálat azt mutatta, hogy a kiújulási pontszám ( = = = ) hatékonyabb volt a node-negatív, ER-pozitív emlőrákban szenvedő nők prognózisának előrejelzésében, mint a standard mérések, mint például a beteg kora, a rák mérete és a rák stádiuma.6
stratégiák a genetikai rendellenességek kimutatásának javítására
a genetikai rendellenességek kimutatására számos módszert alkalmaznak a rákkutatásban. Bár még nem rutinszerűen használják a klinikai környezetben, az alábbiak ígéretesnek tűnnek, és a jövőben felhasználhatók a rák diagnosztizálására, tesztelésére és monitorozására.
Microarray analysis: a Microarray analysis egy olyan technika, amely ötvözi a biológiát a számítástechnikával, hogy egy adott szövetminta genetikai profilját hozza létre, amely több ezer gén aktivitását tükrözi. Ennek a technológiának előnyei vannak a FISH-szel vagy a PCR-rel szemben, mert egyetlen elemzéssel értékelheti az összes gén expresszióját, amelyek részt vehetnek a rákban, nem csak néhány. Grafikusan bemutatva, hogy az összes gén hogyan vesz részt a rákban, a mikrorácsok “genetikai aláírást” generálhatnak egy adott rák számára. Ez pontosabbá teszi a rák altípus azonosítását. Az a képesség, hogy pillanatfelvételt készítsen a rák genetikai aláírásáról, jobban megértheti, hogyan alakul ki a rák, és hogyan kell megtervezni az egyénre szabott kezelést.
hogyan működnek a mikroarray-k? Míg különböző mikroarray módszereket alkalmaznak, mindegyik öt alapvető lépésből áll:
- a minta előkészítése
- a minta kombinálása a számítógépes chiptel
- a számítógépes chip beolvasása
- normalizálás
- az eredmények számítógépes elemzése.
a minta előkészítése: a kezdeti lépésben a cDNS-t RNS-ből reverz transzkripcióval szintetizálják (ne feledje, hogy a transzkripció magában foglalja a DNS másolását RNS előállításához, tehát a reverz transzkripció DNS-t generál RNS-ből) az RNS-ből, amelyet mind tesztből, mind referenciamintából kivontak. A minta DNS-szegmenseit fluorokrómokkal vagy radioaktív vegyi anyagokkal jelölik, hogy azok a számítógépes chiphez való kapcsolódásuk után kimutathatók legyenek.
a minta kombinálása a számítógépes chippel: ezután a mintát kombinálják a számítógépes chippel, amely egy téglalap alakú rács. Minden foltnak sok másolata van egy adott DNS-szekvenciáról. Ezek a szekvenciák a DNS-szekvenciák nyilvános adatbázisaiból származnak, amelyeket a Human Genome Project, Az a tudományos törekvés, amely gyakorlatilag az összes DNS-szekvenciát azonosította az emberi fajban.
amikor a mintát hozzáadják a számítógépes chiphez, egy hibridizációnak nevezett folyamat következik be. Ez azt jelenti, hogy a minta DNS-szegmense kötődik (hibridizálódik) a számítógépes chip azon szegmenséhez, amelynek pontos nukleotidszekvenciája van (a négy vegyület, amely a genetika ábécéje).
a számítógépes chip szkennelése: miután a hibridizáció befejeződött, a szkennereket a fluoreszcencia kimutatására használják, és digitális képet hoznak létre, amely tükrözi, hogy a minta DNS-e a mikroarray chipen lévő foltokkal kombinálva.
normalizálás: Mivel a nyers jelintenzitás sok beteg vagy kísérlet egyes chipjei között változhat, az egyéni chipintenzitást egy közös szabványhoz kell igazítani, vagy normalizálni kell. Például a háttérzaj kivonása egy általános normalizálási módszer, amelyet minden mintára alkalmaznak. A normalizálás lehetővé teszi számos beteg vagy kísérlet génexpressziós profiljának összehasonlítását.
számítógépes elemzés: a mikroarray kísérlet utolsó lépése a számítógépes elemzés. A mikroarray elemzésekből származó több ezer nyers adatpont lényegében érthetetlen, hacsak nem más eredmények összefüggésében értékelik őket. Például a normál és beteg szövetek génexpressziós profilját (mikroarray eredmények) össze lehet hasonlítani az expressziójukban változó gének azonosításával, valamint egy olyan minta (profil) azonosításával, amely a betegség különálló osztályát vagy stádiumát jelezheti.7
mikrotömbök az onkológiában: A mikroarray elemzés hozzájárult az onkológiához azáltal, hogy jobban megértette a rák számos típusának genetikai alapját, beleértve a B-sejtes non-Hodgkin limfómát (BCNHL), az akut leukémiát és az emlőrákot.
- a bcnhl patológiájával kapcsolatban jelentős ismereteket szereztek a beteg és a normál szövetek génexpressziós mintáinak összehasonlításával. Két különböző betegségkategória különálló génexpressziós profilokat mutat. A mikrosugarak segítettek létrehozni ezeket az expressziós profilokat, és a jövőben segíthetnek a bcnhl új eseteinek pontos osztályozásában.
- abban az esetben, akut leukémia, mikroarray segített létrehozni különböző génexpressziós minták, amelyek segítettek megkülönböztetni akut limfocita leukémia (ALL) és akut mieloid leukémia (AML). Ezeket a profilokat használva, 29 nak, – nek 34 a leukémia új eseteit helyesen jósolták meg.
- továbbá a mikroarray segített azonosítani két különböző génexpressziós profilt az emlőrákban, a BCRA1-et és a BCRA2-t. Ez a megállapítás az emlőrák kialakulásának különböző módjait sugallja, és olyan nyomokat ad, amelyek elősegítik az emlőrák okának további megértését.7
1 Spagnolo SD, Ellis DW, Juneja S, Leong AS, et al. A molekuláris vizsgálatok szerepe a limfóma diagnózisában: áttekintés. Patológia 2004; 36 (1) 19-44.
2 Spurbeck JL, Adams SA, Stupca PJ, Dewald GW. Rész: az emberi kromoszómák vizualizálása. Mayo Clinic Proceedings 2004: 79: 58-75.
3 Paik S, Hazan R, Fisher ER, et al. A national surgical adjuváns breast and bowel project patológiai eredményei: az erb B-2 fehérje túlzott expressziójának prognosztikai jelentősége primer emlőrákban. J Clin Oncol 1990; 8: 103-112.
4 Tefferi a, Wieben ED, Dewald GW, et al. Rész: háttér alapelvek és módszerek a molekuláris genetikában. Mayo Clinic Proceedings 2002; 77: 785-808.
5 Tefferi A, Wieben ED, Dewald GW, et al. Rész: háttér alapelvek és módszerek a molekuláris genetikában. Mayo Clinic Proceedings 2002; 77: 785-808.
6 Paik S, Shak S, Tang G, et al. Többgénes PT-PCR vizsgálat a kiújulás előrejelzésére csomópontnegatív emlőrákos betegeknél-NSABP B-20 és B-14 vizsgálatok. A 26.éves San Antonio Mellrák Szimpózium Proc. December 3-8k, 2003; San Antonio, TX, absztrakt # 16.
7 Tefferi A, Bolander ME, Ansell SM, et al. Rész: mikroarray kísérletek és adatelemzés. Mayo Klinika Eljárásai2002; 77: 927-940.