a házi egér (Mus musculus) a rágcsálók rendjébe tartozó Kisemlős, jellegzetesen hegyes orrú, kicsi, lekerekített fülű és hosszú meztelen vagy majdnem szőrtelen farkú. Ez a mus nemzetség egyik leggyakoribb faja. Bár vadállat, a házi egér elsősorban az emberekkel együtt él.A házi egeret háziasították, mint kedvtelésből tartott vagy díszes egeret, és mint laboratóriumi egeret, amely a biológia és az orvostudomány egyik legfontosabb modellszervezete.
Összeszerelés
A GRCm38.a p6 Közgyűlést a Genome Reference Consortium nyújtotta be 2017 szeptemberében. A szerelvény kromoszóma szinten van, 885 csatlakozóból áll, amelyek 336 állványba vannak összeállítva. Ezekből a szekvenciákból 21 kromoszóma épült. Az N50 Méret olyan hosszú, hogy az összeszerelt Genom 50% – a N50 méretű vagy annál hosszabb blokkokban fekszik. A csatlakozók N50 hossza 32 273 079, míg az N50 állvány 52 589 046.
gén annotáció
a gén annotációs folyamatot fehérje-Genom illesztések, megfelelő referenciafajból származó annotációs leképezés és RNS-szekvencia igazítások kombinációjával végeztük (ahol az RNS-szeq adatok és a megfelelő metaadatok nyilvánosan hozzáférhetők voltak). Minden jelölt génrégió esetében kiválasztási eljárást alkalmaztak a legmegfelelőbb átiratkészlet kiválasztására az evolúciós távolság, a forrásadatok kísérleti bizonyítékai és az igazítások minősége alapján.A kis ncrns-eket a BLAST és az Infernal/RNAfold kombinációjával nyerték. A pszeudogéneket úgy számítottuk ki, hogy olyan géneket vizsgáltunk, amelyekben nagy százalékban voltak nem biológiai intronok (intronok <10bp), ahol a gént ismétlődések borították, vagy ahol a gén egyetlen exon volt, és a funkcionális multi-exon paralóg bizonyítékát a genom másutt találták meg. a lincrns-eket RNS-seq adatok segítségével állították elő, ahol a transzkriptumban nem találtak fehérje homológiára vagy fehérje doménekre utaló bizonyítékot.
a Fort Lauderdale-i megállapodásnak megfelelően kérjük, ellenőrizze a genom/összeállítás közzétételének állapotát, mielőtt közzétenné az ezen adatok felhasználásával végzett genomszintű elemzéseket.
