On Oct. 9年後の1962年、ウガンダは独立し、Upcのランゴ指導者であったアポロ-ミルトン-オボテ博士が首相に就任した。 ブガンダにはかなりの自治権が与えられた。 1963年、ウガンダは共和国となり、ムテサは大統領に選出された。 独立の最初の年は、中央政府とブガンダの間の闘争によって支配されました。 1966年、オボテはブガンダの自治を終わらせる新しい憲法を導入した。 バガンダは激しく抗議し、オボテがメンゴのカバカの宮殿を占領し、カバカに国を脱出させ、効果的なバガンダの抵抗を終わらせたときに武器を取る危機に瀕しているように見えた。
1967年には新憲法が導入され、中央政府、特に大統領に多くの権力を与え、ブガンダを四つの地区に分割した。 1969年、オボテは、共通の社会政策を通じて国の民族と地域の違いを橋渡しすることを期待して、左翼のコースに従うことに決めました。
ウガンダはその後、激動の時代を経てきた。 月に。 1971年、オボテは当時国外にいたが、イディ-アミン少将のクーデターで解任された。 彼は次の8年間国を支配することになっていました。
1978年、ウガンダはカゲラ地域を併合しようとしてタンザニアに侵攻した。 タンザニアは1979年に反撃を開始し、ウガンダ民族解放戦線（UNLF）の下で様々な反アミン勢力を効果的に統一した。 アミンの軍は追い出され、アミン自身は国を脱出した。
ウガンダはUNLFの下で複数の国家元首を持つことになっていた。 ユスフ-ルール、ゴドフリー-ビナイサ、ポール-ムワンガが軍事委員会の委員長を務めた。
内紛に苦しんでいたUNLFは、ミルトン・オボテと彼の党であるウガンダ人民会議によって権力から一掃された。 国民抵抗軍（NRA）は全国各地でゲリラ戦を行い、1981年のタンザニア軍の撤退に続いて、元アミン支持者を攻撃した。 1980年代初頭、約200,000人のウガンダ人が近隣のルワンダ、コンゴ、スーダンに避難した。 1985年、軍事クーデターによりオボテは解任され、ティト-オケロ中将が国家元首となった。
新政権での役割が与えられなかったとき、NRAはゲリラキャンペーンを続け、1986年にカンパラを占領し、その指導者であるH.E.Yoweri Kaguta Museveniが新大統領になった。
ウガンダは、1995年10月に新憲法を採択し、以来、同国における民主的統治の基盤を確立してきた土地の最高法として、この新憲法を採択した。
