資源配分の現実世界の問題に費用便益分析の原則を適用する際には、費用便益技術の根底にある福祉経済理論が遵守されるように特別な注意が払われなければならない。 主な問題は、プログラムの良い属性と悪い属性を表すためにコストと便益が同じ意味で使用される場合に発生します。 さらに、相互に排他的なプロジェクトの存在下では、予算資源の使用による正味の利益とは対照的に、個々のプロジェクトの正味の利益（または費用便益 その結果、個々のプロジェクトの経済的評価は、異なるサイズの相互に排他的なプロジェクトの間で選択するために直接関連していません。 両方のタイプの問題は、簡単な例と医療技術の公開された経済的評価の両方を参照することによって示されています。 相互に排他的なプロジェクト間を選択する方法として，整数計画法を提案し，実証した。
