新しい遺伝子の命名? あなたの遺伝子の指定が既に取られているかどうかを確認するために、Sanger Centre pombe genome projectで確認することをお勧めします。 また、公開前に特定の遺伝子座の遺伝子名を予約することもできます。 研究者は、名前を予約するために、名前の変更を提案するために、またはGNC(遺伝子命名委員会)に連絡するために遺伝子レジストリを使用するように GNCは、重複した名前、非標準的な名称、およびその他のそのような問題に対処します。 また、命名規則が最新であることを保証するために、必要に応じて命名規則を改訂します。 上記のサイトから委員会にアクセスしてください。
一般命名規則:分裂酵母遺伝子名は、一般的に三文字、斜体名の後に数字、野生型のプラス(cdc19+;プラスは通常のテキストでは上付きでなければならない)として表現される。 変異体では、プラスは対立遺伝子の指定(cdc1 9−P1)によって置換される。 対立遺伝子の指定は形式で広く変わります;いくつかは手紙、ある数、いくつかの組合せです。
ほとんどの研究者はΔ
(delta)で欠失を示している。 例えば、あなたの好きな遺伝子yfg1+をura4+で破壊すると、適切な株表にΔ
yfg1::ura4+と書かれますが、人々はしばしばΔ
yfg1またはyfg1Δ
をテキストの短い手とし 最近では、yfg1Δ
が優先指定となっています。 挿入せずに構築された欠失対立遺伝子については、いくつかは、Dで始まる対立遺伝子の名称を使用する;例えば、ura4−D1 8は、ura4+の欠失である。 ただし、対立遺伝子の指定の「D」が常に削除であることを確認することはできませんので、注意して文献をお読みください。 欠失対立遺伝子には一意の対立遺伝子の指定、例えばyfg1-D1::ura4+が与えられることが強く奨励されているが、これは典型的ではない。 しかし、いくつかのケースでは、同じ遺伝子が異なる実験室で破壊されており、表現型は正確な構築物に応じて変化する。 与えられた実験室の対立遺伝子のための一意の識別子がなければ、これは文献にかなりの混乱をもたらしました。
::(二重結腸)はゲノムへの挿入を示すために使用される。 これは、欠失/破壊に対応する必要はなく、例えば、下流のマーカーを統合することによって遺伝子座をマーキングすることは、yfg1+::leu1+またはyfg1+::pAb1 2 3と 一般的に、::の前に来るものは遺伝子座であり、それが野生型か変異型かを示す必要があります。::の後に来るものは統合されたものであり、そ 場合によっては、挿入を示すために単一のcolon:を使用し、置換/中断を示すために二重colon::を使用します。
タンパク質はローマ字で示されています。 古い文献では、これに続いて付加されたp(例えば、Cdc19P)が続いた。 Pは、ローマ字対斜体型の規則に慣れていないかもしれない非酵母の人々のために特に有用であるが、それは好意から落ちています。 さらに生命を複雑にするために、出芽酵母の命名法は異なります:野生型の遺伝子名は斜体の大文字(LEU2)であり、変異体(支配的でない限り)は小文字(leu2-3)であり、タンパク質名はローマ字のテキスト(LEU2またはLeu2)である。
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