husmusen (Mus musculus) er Et lite pattedyr Av ordren Rodentia, karakteristisk med en spiss snute, små avrundede ører og en lang naken eller nesten hårløs hale. Det er en av de mest tallrike artene Av slekten Mus. Selv om det er et vilt dyr, lever husmusen hovedsakelig i forbindelse med mennesker.Husmusen har blitt tammet som kjæledyr eller fancy mus, og som laboratoriemusen, som er en av de viktigste modellorganismene i biologi og medisin.
Montering
GRCm38.p6-samlingen ble sendt inn av Genome Reference Consortium i September 2017. Samlingen er på kromosomnivå, bestående av 885 contigs samlet inn i 336 stillas. Fra disse sekvensene har 21 kromosomer blitt bygget. N50-størrelsen er lengden slik at 50% av det samlede genomet ligger i blokker Av n50-størrelsen eller lenger. N50 lengde for contigs er 32,273,079 mens stillaset N50 er 52,589,046.
genannotasjon
genannotasjonsprosessen ble utført ved hjelp av en kombinasjon av protein-til-genom-justeringer, annotasjonskartlegging fra en egnet referanseart og RNA-seq-justeringer (HVOR RNA-seq-data med passende metadata var offentlig tilgjengelige). For hver kandidatgenregion ble det brukt en utvelgelsesprosess for å velge det mest hensiktsmessige settet av transkripsjoner basert på evolusjonær avstand, eksperimentell bevis for kildedataene og kvaliteten på justeringene.Små ncrna ble oppnådd ved hjelp av en kombinasjon AV BLAST og Infernal / RNAfold. Pseudogener ble beregnet ved å se på gener med en stor prosentandel av ikke-biologiske introner (introner på <10bp), hvor genet var dekket i repetisjoner, eller hvor genet var enkeltekson og bevis på en funksjonell multi-exon paralog ble funnet andre steder i genomet. linkrna ble generert via RNA-seq-data der det ikke ble funnet tegn på proteinhomologi eller proteindomener i transkripsjonen.
i Henhold Til Fort Lauderdale-Avtalen, vennligst sjekk publiseringsstatusen til genomet/samlingen før du publiserer noen genom-brede analyser ved hjelp av disse dataene.
