Anta at det er et enkelt gen involvert i koding av pigmentet som gjør iris i det menneskelige øye. Tenk på to alleler eller varianter av dette genet: en for brunt pigment og en annen for blått pigment. Det er kjent at hvis begge forekommer, er uttrykket av det brune pigmentet (N) dominerende med hensyn til det blå (n), kalt recessiv. La oss også huske at homo sapiens er en diploid art; det vil si at hver forelder gir et komplett sett med gener slik at individet har to sett. Således, mens for en person med blå øyne vet vi at fenotype og genotype vil være den samme (blå farge av iris, n og n alleler), i et individ med mørke øyne kan denne fenotype-genotype korrespondanse eksistere (N og n alleler) eller ikke( n og n alleler), og deretter manifestere fenotypen med den dominerende genotypiske karakteren (N).
siden fenotyper er mye lettere å observere enn genotyper, bruker klassisk genetikk fenotyper for å bestemme genfunksjoner. Reproduksjonsforsøk kan teste disse forstyrrelsene. På denne måten kan tidlige genetiske studier spore arvelige mønstre uten å bruke molekylærbiologi.