Navngi et nytt gen? Det er en god ide å sjekke På Sanger Centre pombe genome project for å se om genbetegnelsen din allerede er tatt. Du kan også reservere et gennavn for et bestemt locus før publisering. Etterforskerne oppfordres til å bruke generegisteret til å reservere navn, foreslå navneendringer eller kontakte GNC (gene nomenclature committee). GNC vil adressere dupliserte navn, ikke-standardbetegnelser og andre slike problemer. Det vil også revidere nomenklaturreglene etter behov for å sikre at de er oppdaterte. Tilgang til komiteen gjennom nettstedet ovenfor.
Generelle nomenklaturregler: fisjonsgjærgenavn uttrykkes vanligvis som et tre bokstaver, kursiv navn etterfulgt av et tall, og et pluss for villtype (cdc19+; pluss skal være hevet i normal tekst). I mutanter er pluss erstattet av en allelbetegnelse (cdc19-P1). Allel betegnelser varierer mye i format; noen er bokstaver, noen tall, noen en blanding.
de fleste etterforskere indikerer slettinger med en Δ(delta). For eksempel er en forstyrrelse av favorittgenet yfg1+ med ura4+ skrevet Δyfg1::ura4+ i en riktig belastningstabell, selv om folk ofte bruker Δ yfg1 eller yfg1Δ som kort hånd i tekst. Nylig har yfg1Δ blitt den foretrukne betegnelsen. For sletting alleler konstruert uten en innsetting, noen bruker en allel betegnelse begynner Med D; f. eks, ura4-D18 er en sletting av ura4+. Du kan imidlertid ikke være sikker på at En » D » i en allelbetegnelse alltid er en sletting, så vær forsiktig og les litteraturen. Det er sterkt oppmuntret av noen at sletting alleler gis en unik allel betegnelse, f. eks yfg1-D1:: ura4+ men dette er ikke typisk. Imidlertid har det samme genet i flere tilfeller blitt forstyrret i forskjellige laboratorier, og fenotypene varierer i henhold til den nøyaktige konstruksjonen. Uten en unik identifikator for en gitt lab allel, dette har ført til betydelig forvirring i litteraturen.
:: (dobbelt kolon) brukes til å indikere en innsetting i genomet. Det trenger ikke tilsvare en sletting/avbrudd, for eksempel merking av et locus ved å integrere en markør nedstrøms vil bli indikert yfg1+:: leu1 + eller yfg1+:: pAB123. Generelt, hva kommer før:: er locus, og du må angi om det er villtype eller mutant; hva kommer etter:: er det som ble integrert, og du må også identifisere det. I noen tilfeller bruker folk et enkelt kolon: for å indikere en innsetting, og et dobbelt kolon:: for å indikere en erstatning / forstyrrelse.
Proteiner er angitt med romersk tekst. I eldre litteratur ble dette etterfulgt av en vedlagt p (F.Eks. Cdc19p). P er spesielt nyttig for ikke-gjær folk som kan være ukjent med konvensjonene av romersk versus kursiv type, men det har falt i unåde. Bare for å komplisere livet ytterligere, er spirende gjærnomenklatur forskjellig: wildtype-gennavnene er i kursiv hovedsteder (LEU2), mutanter (med mindre dominerende) er i små bokstaver (leu2-3) og proteinnavn er i romersk tekst (LEU2 eller Leu2).
