Fowler var medlem av en minoritetsgruppe som eide 49,32 prosent Av Padres. Gruppen, ledet av Daværende Padres administrerende direktør Jeff Moorad, forsøkte å kjøpe Padres Fra kontrollerende eier John Moores for $530 millioner, men avtalen falt gjennom i April 2012. Fowler erstattet Deretter Moorad som den generelle partner av minoritetsgruppen, og han tjente På Padres executive committee.
Fowler ble med i en ny gruppe for å kjøpe Padres som inkluderte fire arvinger Til o ‘ Malley—familien-som eide Los Angeles Dodgers-franchisen i fem tiår. Kevin Og Brian O ‘Malley er sønner Av Tidligere Dodgers-eier Peter O’ Malley og barnebarn Av Walter O ‘ Malley, eieren som flyttet Dodgers vestover fra Brooklyn etter 1957-sesongen. Peter Og Tom Seidler er Nevøene Til Peter O ‘ Malley. MLB godkjente salget på 800 millioner dollar, som ble fullført 28. August 2012. Så mye som $200 millioner av salgsprisen inkluderte lagets 20 prosent eierandel I Fox Sports San Diego, en kabelkanal som betaler Padres årlige avgifter som en del av en $1.2 milliarder, 20-årig avtale. Fowler ble utnevnt til eierskapsgruppens styreformann og ble utpekt til å representere Padres i alle ligamøter. Han ble den første lokalt baserte kontrollpersonen i laget siden grunnleggelsen eier C. Arnholdt Smith. Under Fowler/Siedler/O ‘ Malley-gruppen har Padres signert 3 spillere til kontrakter som slo den forrige franchise-platekontrakten, og ga 6 år og $83 millioner Til Wil Myers i januar 2017, 8 år og $ 144 millioner Til Eric Hosmer i februar 2018, og 10 år og $300 millioner Til Manny Machado i februar 2019.
DEN 18. November 2020 godkjente MLB At Fowler overførte rollen som styreformann til Peter Seidler, som kjøpte en eierandel i teamet Fra Fowler for å bli den største interessenten. Fowler forblir med laget som nestleder.
