zaciski przesuwne znajdują się we wszystkich domenach życia i są niezbędne do wydajnej replikacji DNA, która jest wymagana za każdym razem, gdy komórka dzieli się, a także do koordynowania ruchu na DNA. Escherichia coli (E. coli) beta-clamp jest białkiem w kształcie pierścienia składającym się z dwóch identycznych monomerów kodowanych przez gen dnaN, który wiąże się z polimerazą DNA III i ułatwia wysoki stopień procesywności wymaganej do replikacji DNA. Przesuwne białka zaciskowe otwierają się i są ładowane na określone struktury DNA przez Ładowarki zaciskowe w obecności ATP. Naszym celem jest uzyskanie wglądu w udział różnych domen w funkcji beta za pomocą linked‐beta‐clamp, który ogranicza homodimer na jednym z dwóch interfejsów. Zwykle homo-dimeryczna struktura beta-zacisku pozwala mu działać jako molekularny pas narzędziowy, wiążąc więcej niż jedno białko jednocześnie w określonych miejscach interakcji białek na zacisku. Tak więc, lepsze zrozumienie roli zacisków przesuwnych w procesie tolerancji na uszkodzenia DNA zostanie zebrane poprzez zbadanie, czy jeden interfejs lub miejsce wiązania jest odpowiednie dla załadunku DNA lub dla innych interakcji białkowych. Aby utworzyć tę konstrukcję, zoptymalizowano długość i sekwencję linkera, a także warunki wyrażenia. Białka linked-beta scharakteryzowano za pomocą testu denaturacji termicznej i wykazywały porównywalną stabilność termiczną do beta typu dzikiego. W teście ATPazy wykryto podobne ilości nieorganicznego fosforanu w reakcjach zawierających beta lub beta typu dzikiego, co wskazuje, że zaciskacz może wchodzić w interakcje z obiema wersjami zacisku beta. Obecnie badamy, czy połączone i dzikiego typu beta poprawiają procesywność polimerazy w teście przedłużania startera. Obecnie konstruujemy i scharakteryzujemy warianty beta typu dzikiego i linked-beta, aby przetestować znaczenie pozostałości tylko na jednym z interfejsów lub partnerskich miejsc wiązania białek.
