Załóżmy, że istnieje tylko jeden gen zaangażowany w kodowaniu pigmentu, który sprawia, że tęczówki ludzkiego oka. Pomyślmy o dwóch allelach lub odmianach takiego genu: jednym dla brązowego pigmentu i jednym dla niebieskiego pigmentu. Wiadomo, że w obu przypadkach ekspresja brązowego pigmentu (N) jest dominująca w porównaniu z Niebieskim (n) zwanym recesywnym. Przypomnijmy również, że homo sapiens jest gatunkiem diploidalnym; to znaczy, każdy rodzic przynosi pełny zestaw genów, dzięki czemu osoba posiada dwa zestawy. Tak więc, chociaż dla osoby o niebieskich oczach wiemy, że będą one identycznym fenotypem i genotypem (niebieski kolor tęczówki, allele n I n), u osoby o ciemnych oczach ta zgodność fenotyp-genotyp może istnieć (allele N I N) lub nie (allele N I n), wtedy fenotyp objawia się dominującym charakterem genotypowym (N).
ponieważ fenotypy są znacznie łatwiejsze do zaobserwowania niż genotypy, klasyczna genetyka wykorzystuje fenotypy do określenia funkcji genów. Eksperymenty z odtwarzaniem mogą przetestować te zakłócenia. Tak więc wczesne badania genetyczne są w stanie śledzić wzorce przodków bez użycia biologii molekularnej.