Prawidłowa mikrobiota układu oddechowego w zdrowiu i chorobie

poważne infekcje układu oddechowego stanowią zagrożenie dla wszystkich pacjentów hospitalizowanych, ale są szczególnie częste na oddziale intensywnej terapii (OIOM). Pacjenci przyjęci do OIOM są bardziej narażeni na rozwój szpitalnego zapalenia płuc niż pacjenci przyjęci do innych oddziałów w szpitalu, a pacjenci wentylowani są na 3-10 razy zwiększone ryzyko rozwoju szpitalnego zapalenia płuc w porównaniu z tymi, którzy nie są wentylowani. Dzieje się tak po części dlatego, że wielu pacjentów OIOM wymaga wsparcia respiratora, aby pomóc w przypadku zablokowanych ścieżek lub innych warunków, które uniemożliwiają im samodzielne oddychanie. Wentylacja polega na umieszczeniu rurki intubacyjnej w tchawicy, aby dostarczyć tlen bezpośrednio do płuc, co jest procedurą ratującą życie, ale nie pozbawioną ryzyka. Z wielu powodów pacjenci wentylowani mechanicznie są szczególnie podatni na rozwój zapalenia płuc. W rzeczywistości zapalenie płuc jest drugim najczęstszym zakażeniem szpitalnym dotykającym krytycznie chorych pacjentów na OIOM.

zapalenie płuc związane z respiratorem i rola prawidłowej flory oddechowej

pacjenci są najbardziej narażeni na ryzyko rozwoju zapalenia płuc związanego z respiratorem (Vap) w ciągu pierwszych 48 godzin po umieszczeniu rurki intubacyjnej. Umieszczenie rurki zakłóca normalną anatomię dróg oddechowych i uniemożliwia pacjentowi Połykanie, kaszel lub usuwanie śluzu i innych wydzielin normalnie. Ponieważ wydzieliny te gromadzą się w gardle, bakterie żyjące w drogach oddechowych mogą zacząć gromadzić się wzdłuż rurki dotchawiczej. Jeśli pacjent aspiruje tych bakterii, mogą one spowodować zakażenie w płucach.

Przedstawienie umieszczenia rurki intubacyjnej u krytycznie chorego pacjenta.
opis umieszczenia rurki intubacyjnej u krytycznie chorego pacjenta.

organizmy, które normalnie żyją w drogach oddechowych, mogą być tymi samymi organizmami, które wywołują zapalenie płuc u tych pacjentów. Zrozumienie, że pojedynczy organizm może być normalną mikrobiotą lub patogenem, zachęca mikrobiologa i klinicystę do rozważenia innych kluczowych czynników podczas diagnozowania VAP, takich jak to, które organizmy stanowią normalną florę oddechową i co sprawia, że niektórzy członkowie mikrobioty oddechowej są bardziej patogenni niż inni.

organizmy komensalne mogą powodować szkody

podobnie jak cała ludzka skóra i powierzchnie błon śluzowych, drogi oddechowe są skolonizowane przez bakterie komensalne, które chronią gospodarza przed chorobami, zwiększają tempo odnowy komórek nabłonkowych i promują produkcję immunoglobulin śluzowych. Trudność w zdiagnozowaniu przyczyny VAP wynika z faktu, że wiele z tych organizmów może powodować choroby. Czy organizmy obecne po prostu kolonizują rurkę intubacyjną i otaczające drogi oddechowe bez wyrządzania szkody, czy też są przyczyną infekcji? W tabeli 1 wymieniono organizmy najczęściej izolowane z dróg oddechowych oraz rolę, jaką mogą odgrywać zarówno w nieszkodliwej kolonizacji, jak i w chorobie.

miejsce wykrycia
Oropharynx i Nosopharynx

paciorkowce z grupy C lub G

  • najczęściej reprezentują kolonizację, ale mogą powodować pojedyncze przypadki i ogniska objawowego zapalenia gardła.

paciorkowce grupy A

  • kolonizują do 20% dzieci.
  • rzadziej: powoduje zapalenie gardła lub miejscowe infekcje dróg oddechowych.
  • związek między inwazyjną chorobą paciorkowców grupy A A kolonizacją gardła nie jest jasny.

Streptococcus pneumoniae

  • duża liczba (6% do 100%) niemowląt i małych dzieci jest kolonizowana.
  • około 25% dzieci w wieku od 3 miesięcy do 4 lat jest kolonizowanych, a 5-10% osób starszych i młodszych.
  • może trwać od tygodni do miesięcy na tej stronie.
  • Growing S. pneumoniae z hodowli jamy ustnej i gardła / nosogardzieli nie ma znaczenia, ale około 15% dzieci rozwinie zakażenia kliniczne w ciągu jednego miesiąca od nabycia nowego szczepu.
  • u dziecka, u którego rozwija się wirusowe zakażenie górnych dróg oddechowych podczas kolonizacji, może rozwinąć się ostre zapalenie ucha środkowego lub zapalenie zatok.

Haemophilus influenzae i Moraxella catarrhalis

  • duży odsetek niemowląt i małych dzieci jest kolonizowany.
  • wzrost tych organizmów z hodowli jamy ustnej i gardła / nosogardzieli nie ma znaczenia, ale dzieci z infekcjami górnych dróg oddechowych mogą rozwinąć wtórne infekcje, takie jak zapalenie ucha środkowego lub zapalenie zatok, jeśli są skolonizowane.

Neisseria meningitidis

  • 5 do 30% populacji jest skolonizowana, przy czym największy odsetek stanowią młodzież i Młodzi dorośli.
  • wyhodowanie tego organizmu z kultury jamy ustnej lub nosogardzieli nie ma znaczenia, ale kolonizacja może prowadzić do bakteriemii, zapalenia opon mózgowych lub septycznego zapalenia stawów.
dolne drogi oddechowe

Streptococcus pneumoniae

  • częste zanieczyszczenie górnych dróg oddechowych (gdzie jest to organizm kolonizujący), ale także częstą przyczyną chorób dolnych dróg oddechowych. Znaczenie obecności tego organizmu w kulturze będzie w dużym stopniu zależeć od obrazu klinicznego, innych badań diagnostycznych i dominacji w kulturze.

Staphylococcus aureus

  • około jedna trzecia dorosłych osób kolonizuje S. aureus w górnych drogach oddechowych. Organizm ten jest jedną z najczęstszych przyczyn VAP, a poważna choroba S. aureus jest prawie zawsze poprzedzona kolonizacją.

Niewykazywalne Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis i gatunki Enterococcus

  • rzadko powodują infekcje dolnych dróg oddechowych lub VAP. Jeśli są uprawiane w hodowli z dolnych dróg oddechowych, jest prawdopodobne, że stanowią zanieczyszczenie z kolonizacji górnych dróg oddechowych.

Enterobacteriaceae i niefermentujące pałeczki Gram-ujemne

  • organizmy te należą do najczęstszych przyczyn VAP.
  • Mogą one stać się nową „normalną mikrobiotą” wentylowanych dzieci na OIOM, a ich obecność w hodowli może nie zawsze wskazywać na infekcję.
  • znaczenie tych organizmów w kulturze zależy w dużej mierze od obrazu klinicznego, innych badań diagnostycznych i dominacji w kulturze.

paciorkowce z grupy Viridans, paciorkowce Bezhemolowe, gronkowce koagulazo-ujemne, bez patogenne gatunki Neisseria, gatunki Corynebacterium, gatunki Lactobacillus, gatunki Micrococcus, gatunki Stomatococcus i gatunki Bacillus

  • część prawidłowej mikrobioty górnych dróg oddechowych i niezwiązana z chorobą kliniczną.

Tabela 1. Najczęściej izolowane organizmy z dróg oddechowych i ich znaczenie.

wiele patogenów oddechowych żyje normalnie w gospodarzu, nie wywołując choroby. Identyfikacja jednego z tych organizmów jako przyczyny zakażenia musi odbywać się w kontekście klinicznych objawów przedmiotowych i podmiotowych zapalenia płuc*. Leczenie wszystkich organizmów zidentyfikowanych z hodowli dróg oddechowych może prowadzić do nadużywania antybiotyków i zachęcać do rozwoju organizmów opornych na antybiotyki. Co sprawia, że te pozornie normalne bakterie są tak niebezpieczne i jak mogą żyć w ludziach i nie powodować chorób przez większość czasu, ale czasami powodować śmiertelne infekcje? Ważne jest, aby zrozumieć, jak niektóre z najczęstszych przyczyn zapalenia płuc przejście od kolonizatorów patogenów oportunistycznych. Poniżej znajdują się 3 główne bakterie związane z VAP I cechy, które pozwalają im to zrobić.

gramowa plama próbki układu oddechowego od pacjenta bez zapalenia płuc
gramowa plama próbki układu oddechowego od pacjenta bez zapalenia płuc

źródło: Zdjęcie dzięki uprzejmości A. Prinzi.

Streptococcus pneumoniae jako patogen dolnych dróg oddechowych

Streptococcus pneumoniae jest normalnym kolonizatorem dróg oddechowych, ale jest główną przyczyną śmiertelności z powodu zapalenia płuc na świecie. Światowa Organizacja Zdrowia (WHO) szacuje, że organizm ten jest odpowiedzialny za zabijanie pół miliona dzieci na całym świecie każdego roku.
cecha zjadliwości: kapsułka polisacharydowa.

  • pomaga bakterii uniknąć obrony gospodarza.
  • kapsułka, która jest naładowana ujemnie, pozwala bakterii uniknąć utknięcia w śluzie, dotrzeć i dołączyć do komórek nabłonkowych.

cecha zjadliwości: białka powierzchniowe (takie jak liaza hialuronowa)

  • zachęcają i promują przywiązanie.
  • Promuj produkcję biofilmu, aby więcej organizmów mogło się przyłączać i rozmnażać.

jeśli kolonizacja S. organizmy pneumoniae mogą przedostać się do dolnych dróg oddechowych, w wyniku zaburzeń anatomicznych, takich jak rurka dotchawicza, pierwotna infekcja wirusowa, taka jak grypa lub aspiracja, bakterie wykorzystują różne czynniki chorobotwórcze, aby dołączyć do komórek pęcherzykowych i zapalić odpowiedź zapalną gospodarza, powodując zapalenie płuc.

mucoid S. pneumoniae colonies on a blood agar plate. Wygląd śluzówki jest spowodowany szczególnie obfitą produkcją kapsułek u tego szczepu S. pneumoniae.
mucoid S. pneumoniae colonies on a blood agar plate. Wygląd śluzówki jest spowodowany szczególnie obfitą produkcją kapsułek u tego szczepu S. pneumoniae.

Pseudomonas aeruginosa jako patogen dolnych dróg oddechowych

Pseudomonas aeruginosa nie jest powszechnie częścią mikrobioty dróg oddechowych,ale może stać się kolonizatorem u pacjentów, którzy zostali przyjęci do szpitala przez dłuższy czas. Dotyczy to również innych Gram-ujemnych prętów, w tym Enterobacterales. U pacjenta hospitalizowanego, szczególnie intubowanego, nie jest bezpieczne zakładanie, że obecność P. aeruginosa w hodowli oddechowej automatycznie równa się infekcji. To powiedziawszy, u pacjentów z potwierdzonym VAP, P. aeruginosa jest najczęstszą przyczyną bakteryjną. Jeśli P. aeruginosa jest dominującym organizmem rosnącym w hodowli aspiratu tchawicy od wentylowanego pacjenta z objawami zapalenia płuc, jest to prawdopodobnie patogen sprawczy.
wpływ P. aeruginosa na intubowanego pacjenta będzie różny w zależności od serotypu:

  • Izolaty z serotypami O6 i O11 kolonizują ludzi częściej niż inne serotypy, ale 60% pacjentów rozwiązuje zakażenia VAP tymi serotypami.
  • serotypy O1 i O2 są mniej powszechne i wiążą się z większą śmiertelnością.

patogenność P. aeruginosa jest bardzo złożona, a organizm wykorzystuje kilka mechanizmów do przylegania do żywych i nieożywionych powierzchni. Jego liczne właściwości adhezyjne pozwalają P. aeruginosa tworzyć biofilmy, szczególnie na urządzeniach medycznych; tworzenie biofilmu na rurkach intubacyjnych zwiększa ryzyko nabycia VAP u pacjenta, jeśli organizm przeniesie się do płuc.

Staphylococcus aureus jako patogen dolnych dróg oddechowych

prawie jedna trzecia dorosłych osób jest skolonizowana przez Staphylococcus aureus w ich drogach oddechowych. Podczas gdy wiele osób nigdy nie rozwinie się powikłań w wyniku kolonizacji S. aureus, dorośli, którzy są skolonizowani i intubowani, są 15-krotnie bardziej narażeni na rozwój zapalenia płuc S. aureus w porównaniu do tych, którzy nie zostali skolonizowani. Ponadto S. aureus jest odpowiedzialny za >20% przypadków VAP, z których 50% jest spowodowane przez MRSA.
cecha zjadliwości: białka powierzchniowe bakterii, w szczególności białko a, są niezbędne dla organizmu, aby mógł powodować śmiertelność związaną z zapaleniem płuc.
chociaż te liczby są przerażające, ważne jest, aby pamiętać, że duża część populacji jest skolonizowana tym organizmem, a obecność go w kulturze nie od razu sugeruje infekcję.

czynniki układu oddechowego jako patogeny: wszystko biorąc pod uwagę

relacje między ludźmi a bakteriami są niezwykle złożone. Normalna mikrobiota układu oddechowego może odgrywać kluczową rolę w zdrowiu człowieka, ale może również odgrywać rolę w ciężkich chorobach układu oddechowego. Zrozumienie tych relacji może pomóc społeczności Mikrobiologii Klinicznej i chorób zakaźnych lepiej zrozumieć, jak rozszyfrować wyniki diagnostyczne, jeśli chodzi o szpitalne zapalenie płuc.
* jak mikrobiolog kliniczny może postawić diagnozę w kontekście objawów klinicznych? Pamiętaj, aby złapać następny artykuł z tej serii, który omówi wyzwania i korzyści diagnostyki zapalenia płuc.

powyższe reprezentuje poglądy autora i niekoniecznie odzwierciedla opinię Amerykańskiego Towarzystwa mikrobiologicznego.



+