vid tillämpning av principerna för kostnads-nyttoanalys på verkliga problem med resursfördelning måste särskild försiktighet vidtas för att säkerställa att den välfärdsekonomiska teorin som ligger till grund för kostnads-nyttotekniken följs. Stora problem uppstår när kostnader och fördelar används omväxlande för att representera de goda och dåliga egenskaperna hos ett program. I närvaro av ömsesidigt uteslutande projekt kan fokus på nettofördelarna (eller kostnads-nyttoförhållandena) för enskilda projekt i motsats till nettofördelarna med användningen av budgeterade resurser leda till partiska uppskattningar av projektens skuggpris och följaktligen fel i analytikernas slutsatser. Som ett resultat är ekonomiska bedömningar av enskilda projekt inte direkt relevanta för att välja mellan ömsesidigt exklusiva projekt av olika storlekar. Båda typerna av problem illustreras med hänvisning till både enkla exempel och publicerade ekonomiska bedömningar av vårdtekniker. Heltalsprogrammering föreslås och demonstreras som en metod för att välja mellan ömsesidigt exklusiva projekt.
