Organogeneze
Organogeneze je proces, při kterém tří zárodečných vrstev tkáně embrya, která jsou ektoderm, endoderm a mesoderm, rozvíjet do vnitřních orgánů organismu. Orgány se tvoří z zárodečných vrstev diferenciací: proces, kterým se méně specializovaná buňka stává více specializovaným typem buněk. K tomu musí dojít mnohokrát, protože zygota se stává plně vyvinutým organismem. Během diferenciace embryonální kmenové buňky exprimují specifické sady genů, které určí jejich konečný typ buněk. Například některé buňky v ektodermu exprimují geny specifické pro kožní buňky. V důsledku toho se tyto buňky diferencují na epidermální buňky. Proto je proces diferenciace regulován buněčnými signalizačními kaskádami.
u obratlovců je jedním z primárních kroků během organogeneze tvorba nervového systému. Ektoderm tvoří epiteliální buňky a tkáně, stejně jako neuronální tkáně. Během tvorby nervového systému signalizují speciální signalizační molekuly nazývané růstové faktory některé buňky na okraji ektodermu, aby se staly buňkami epidermis. Zbývající buňky ve středu tvoří neurální desku. Pokud by byla signalizace růstovými faktory narušena, pak by se celý ektoderm diferencoval na nervovou tkáň. Neurální deska prochází řadou buněčných pohybů, kde se valí a tvoří trubici zvanou neurální trubice. V dalším vývoji neurální trubice způsobí vznik mozku a míchy.
mezoderm, který leží na obou stranách neurální trubice obratlovců, se vyvine do různých pojivových tkání zvířecího těla. Prostorový vzorec genové exprese reorganizuje mezoderm do skupin buněk zvaných somity, s mezerami mezi nimi. Somité se dále vyvinou do žeber, plic a segmentového (páteřního) svalu. Mezoderm také tvoří strukturu zvanou notochord, která je tyčovitá a tvoří centrální osu zvířecího těla.
endoderm sestává nejprve ze zploštělých buněk, které se následně stávají sloupcovitými. To tvoří epiteliální výstelka celá trávicí trubice (kromě části úst a hltanu) a terminální části konečníku (která je lemována involutions ektodermu). To také tvoří podšívka buňky všech žláz, které se otevírají do trávicí trubice včetně jater a slinivky břišní; epitelu sluchové trubice a bubínkové dutiny, průdušnice, průdušek a vzduch buňky plic, močového měchýře a část močové trubice, a folikulu podšívka štítné žlázy a brzlíku. Navíc, endoderm formy vnitřních orgánů, včetně žaludku, střeva, jater, slinivky břišní, močového měchýře, epitelové části průdušnice, plíce, hltanu, štítné žlázy, příštítných tělísek, a střev.