z větší části byla armáda Inků organizována velmi podobně jako naše moderní armáda. Na základě desetinných jednotek měla jednotka deseti mužů desátníka a pět skupin po deseti mělo seržanta. Tento rozkaz pokračoval s důstojníky dohlížejícími na skupiny 100, 500, 1 000 a 5 000. Konečným velitelem byl sapa inca (císař). Vynikající služba v armádě byla odměněna bez ohledu na sociální postavení válečníků.
ruční boj byl nejčastější formou boje. Inkové používali bojové sekery a kopí z mědi, bronzu a kamene. Tyto zbraně však nebyly dostatečně ostré, aby pronikly do španělského brnění. Také používali sortiment klubů. Největší, porra, vyžadovala dvě ruce. Skládala se z dlouhé dřevěné rukojeti s koulí z mědi nebo kamene, která měla pět nebo šest vyčnívajících bodů. Porra nebyl schopen proniknout do španělské přilby. Jednou z jejich nejúčinnějších zbraní používaných inky byl prak nebo warak ‚ a. házel kameny takovou silou, že mohli zlomit španělský meč ve dvou. Inkové používali luk a šípy, ale nebyli příliš přesní a byli také nepoužitelní proti španělskému brnění.
vojáci Inků byli ve věku od 25 do 50 let. Všichni měli rozsáhlý vojenský výcvik. Měli na sobě bavlněné nebo alpakové tuniky a jejich přilby byly vyrobeny z proutí. Mnoho přileb bylo zdobeno pestrobarevným peřím. Taky, měli na sobě hustě prošívané bavlněné brnění.
Inkové se seřadili podle zbraně, kterou nesli. Ti, kteří nesli zbraně, které by mohly zasáhnout z dálky, byly umístěny na přední linii. Jednalo se o lukostřelce, prakové vrhače a oštěpy. Následovali je sekyra a klub ovládající jednotky. Vojenští velitelé Inků byli ve vrzích vyneseni na bojiště. Před vstupem do bitvy se císař a jeho vojáci postili. Půst skončil obrovským svátkem a konzumací obrovského množství kukuřičného piva.
vojenská strategie Inků nebyla složitá. Rozdělili své síly do tří skupin. První skupina zaútočila zepředu, zatímco ostatní dvě skupiny kroužily a útočily zezadu. Inkové také přerušili dodávky vody, komunikace a zásobování potravinami. Když se Inkové blížili ke svým nepřátelům, vydávali zvuky uší. Foukali lastury, píšťalky, bili bubny, tančili a křičeli. Tato strategie by vyděsila nepřátelské síly. Někdy armáda Inků přidala do svých arzenálů zbraně zemí, které porazili. Takto objevili Bolu, která byla velmi účinná proti španělským koním. Bola provaz se třemi kameny připevněnými, a když byl správně hozen, mohl obepínat paže a nohy nepřítele.
