Molecular havaitseminen toxigenic C difficile: toksiini A tai B geeni?

Clostridium difficile-infektiot (CDIs) ovat yleisin sairaalaripulin aiheuttaja, ja ne vaikuttavat pääasiassa antibiooteille altistuneisiin potilaisiin. Tartunnat ovat liittyneet pitkittyneisiin sairaalajaksoihin ja merkittäviin terveydenhuollon kustannuksiin. Viimeaikaiset muutokset CDI: n epidemiologiassa ovat lisääntyneet esiintyvyyden ja taudin vakavuuden vuoksi, mikä johtuu osittain (BI/NAP1/027) – kannan esiintymisestä, joka on nykyään endeeminen monissa yhdysvaltalaisissa sairaaloissa.1 kliinikot ovat myös havainneet infektioiden lisääntymistä aiemmin vähäriskisissä väestöryhmissä ja yhteisöstä hankituissa TKI-tapauksissa perinteisten riskitekijöiden puuttuessa.

vain toksiinia tuottavat C-diff-kannat aiheuttavat tauteja ja toksiineilla A ja B (joita koodaavat tcda-ja tcdB-geenit) näyttää olevan tärkeä rooli. Toksiinit ovat proinflammatorisia enterotoksiineja, mutta B-toksiini on voimakkaampi sytotoksiini.2 suora ulosteen sytotoksisuus, joka havaitsee toksiini B: n, oli ensimmäinen kliinisesti hyödyllinen diagnostinen määritys. 1990-luvun alussa kehitettiin nopeat entsyymi-immunomääritykset (EIAs) toksiinin a havaitsemiseksi, joka on immunogeenisempi kuin toksiini B. monet laboratoriot hyväksyivät nämä määritykset, koska ne olivat käteviä ja helppokäyttöisiä.

vuonna 2000 ilmenneet vakavat CDI-tapaukset, jotka johtuivat kannoista, joista puuttui a-toksiini (A-B+ – muunnokset), olivat ensimmäinen vihje siitä, että A-toksiini ei ollut välttämätön kliinisen sairauden kannalta.3,4 CDI-potilasta, joilla oli näitä varianttikantoja, diagnosoitiin väärin, koska heidän ulostenäytteensä olivat negatiivisia toksiini A: lle spesifisten EIA: iden vuoksi.3 asianmukaisen hoidon puuttuessa joillekin potilaille kehittyi vakavia CDI-komplikaatioita, joiden tulokset olivat huonoja, mukaan lukien kuolema.3,4 vastauksena toksiini a-negatiivisten varianttien C-diff-kantojen syntyyn kit-valmistajat kehittivät uusia EIAs: iä, joissa havaittiin myös toksiini B: tä, koska ei ollut enää hyväksyttävää havaita toksiinia a yksinään.

suurin osa tautia aiheuttavista toksigeenisistä C-eroista tuottaa molempia toksiineja. A-B+ – toksiinikantojen osuus on kuitenkin 2-11 prosenttia TAUTITAPAUKSISTA5, ja arviot ovat korkeammat Irlannissa6 ja Aasiassa.7 nämä kannat, joilla on suuria deleetioita tcdA-geenissä, aiheuttavat saman taudin kirjon kuin ne, jotka tuottavat molempia toksiineja, vaihtelevat lievästä ripulista pseudomembranoottiseen koliittiin.4 joidenkin raporttien mukaan A-B+ – toksiinikantojen aiheuttama tauti on kuitenkin todennäköisemmin vakava.7

sitä vastoin raportit luonnossa esiintyvistä tautia aiheuttavista kannoista, jotka eivät tuota toksiinia B (toksiini A+B – variantteja), ovat erittäin harvinaisia. Kirjallisuudessa ainoa raportti A+B – kannan tartunnasta oli potilas, jolla oli toistuva CDI, jolta aiemmin eristettiin sekä tcda-että tcdB-geenejä sisältäviä C-diff-isolaatteja.Aikaisempien ripulikohtausten aikana potilaalta otetuista ulostenäytteistä 8 oli sytotoksisuusmäärityksellä positiivisia B-toksiinin suhteen. Kolmannen jakson A+B – kannan tutkiminen paljasti tcdb-geenin tai muiden toksiinin tuotantoon tarvittavien geenien täydellisen puuttumisen ja tcda-geenin poiston.9 Futhermore, A + B-variantti ei tuottanut toksiinia A tai toksiinia B in vitro, mikä kyseenalaistaa sen merkityksen potilaan oireiden aiheuttajana.

kyky luoda geneettisesti C-diff, joka tuottaa ainoastaan toksiinia A (A+B – mutantit) tai toksiinia B (A-B+ mutantit) ja tartuttaa mutanteilla alttiit hamsterit, on johtanut kahteen tutkimukseen näiden toksiinien yksilöllisestä merkityksestä tautiprosessissa. Eräässä tutkimuksessa kirjoittajat päättelivät, että toksiini B on välttämätön taudille, kun taas toksiini A: ta ei tarvita.10 toinen tutkimus osoitti, että jompikumpi toksiini kykeni aiheuttamaan sairauksia, mutta että pelkästään toksiinia B tuottavat mutanttikannat aiheuttivat vakavampia sairauksia.11 Vaikka nämä kaksi tutkimusta näyttävät olevan ristiriidassa keskenään, Lyraksen ja muiden löydökset vastaavat paremmin tähänastista kliinistä käytäntöä, koska kaikki kliinisesti merkittävät C-diffin kannat (mukaan lukien A+B+ ja A-B+ – muunnokset) tuottavat toksiinia B ja koska luonnossa ei esiinny tautia aiheuttavia kantoja, jotka tuottavat ainoastaan toksiinia A.

laboratoriokokeet toksigeenisen C-diff: n toteamiseksi CDI-diagnoosin varmistamiseksi potilailla ovat edelleen haasteellisia, koska yleisesti käytetyt toksiini A/B EIA: t ovat tehokkaita tai herkempien menetelmien, kuten toksigeenisen viljelyn, läpimenoajat ovat muuttuneet.12 toksigeenisen C-diff: n nopea molekyylitestaus on parantanut merkittävästi sitä tarkkuutta, jolla CDI-potilaat voidaan diagnosoida ja hoitaa. Luotettavien toksigeenisen viljelmän herkkyyksien ja erityispiirteiden vuoksi lääkärit voivat luottaa laboratoriotuloksiin, jotka vahvistavat heidän kliinisen epäilynsä CDI: stä tai sulkevat pois C-diff: n, joka on potilaan oireiden lähde. Uuden SHEA/IDSA (Society for Healthcare Epidemiology of America and Infectious Diseases Society of America) clinical practice guidelines for CDI in adults, mukaan PCR-testaus näyttää olevan nopeaa, herkkää ja erityistä ja saattaa Viime kädessä puuttua testaukseen liittyviin huolenaiheisiin.12

kaikki FDA: n selvittämät reaaliaikaiset polymeraasiketjureaktion eli PCR: n määritykset kohdistuvat toksiini B-geeniin (tcdB). Tcdb: n valinta molekyylikohteeksi on ihanteellinen useista syistä: toksiini B: n olennainen rooli tautiprosessissa10,11; toksiini B: n ja tcdB: n esiintyminen kaikissa tautia tuottavissa kannoissa; ja näyttö siitä, että tcdb: n toteaminen oireilevilla potilailla korreloi hyvin CDI: n tarkan diagnoosin kanssa.13

muiden kohteiden, kuten tcdA-geenin, perustelut ovat epäselvempiä. Monilla A-B+ – muunnoksen C-muunnelmilla on poistumia a-gene14-toksiinista, eivätkä ne välttämättä ole luotettavia kohteena. Toisin kuin tcdB-geeni, tutkimukset, jotka osoittavat,että tcda: n osoittaminen korreloi kliinisen sairauden kanssa, puuttuvat; ja koska geeni saattaa löytyä myös yksinään muista kuin tautia aiheuttavista kannoista, 15 tcda: n osoittaminen voi mahdollisesti johtaa CDI: n väärään diagnoosiin.

CDI-diagnoosi edellyttää kliinisten oireiden yhdistämistä ja toksigeenisen C-eron tarkkaa toteamista oireilevan potilaan ulosteesta.12 kun tcdB-geeniin kohdistuvia PCR-määrityksiä käytetään asianmukaisesti ja ne on rajattu potilaisiin, joilla on kliiniseen tautiin viittaavia oireita, ne voivat helpottaa CDI: n tarkkaa diagnosointia, mikä puolestaan voi johtaa potilaiden parempaan hoitoon asianmukaisella hoidolla ja infektioiden torjuntatoimien pikaiseen toteuttamiseen.

Diane Kawa, PhD, SM(ASCP),
on johtaja, tieteelliset asiat BD Franklin Lakes, NJ.

  1. McFarland LV. Curr Opin Gastroenterol. 2009;25(1):24.
  2. Lyerly, DM, et al. Clin Microbiol Rev. 1988;1(1): 1.
  3. Johnson S, et al. Ann Intern Med. 2001;135(9):434.
  4. Alfa MJ, et al. J Clin Microbiol. 2000;28(7);1706.
  5. Geric B, et al. J Med Microbiol. 2004;53(9);887.
  6. Drudy D, et al. Clin Microbiol Infect. 2007;13(3):298
  7. Freeman J, et al. Clin Microbiol Rev. 2010;3: 529.
  8. Cohen SH, et al. Clin Tartuttaa Tämän. 1998;26(2):410.
  9. Cohen SH, Tang YJ, Silva J Jr. J Infect Dis. 2000;181(2):659.
  10. Lyras D, et al. Luonto. 2009;458(4):1175.
  11. Kuehne SA, et al. Luonto. Epub: 10.1038 / nature09397 (15.9.2010).
  12. Cohen SH, et al. Infect Control Hosp Epidemiol. 2010;31(5);431.
  13. Peterson LR, et al. Clin Infect Dis. 2007;45(11):1152.
  14. Rupnik M. FEMS Microbiol Rev. 2008;32(5):541.
  15. Rupnik M, et al. Microbiology. 2001;147(2):439.



+