nimeäminen Uusi geeni? Sanger Centre pomben genomiprojektissa kannattaa tarkistaa, onko oma geeninimitys jo otettu. Voit myös varata geeninimen tietylle lokukselle ennen julkaisua. Tutkijoita kehotetaan varaamaan geenirekisterin avulla nimiä, ehdottamaan nimenmuutoksia tai ottamaan yhteyttä GNC: hen (gene nomenclature committee). GNC käsittelee päällekkäisiä nimiä, epätyypillisiä nimityksiä ja muita tällaisia kysymyksiä. Se myös tarkistaa tarvittaessa nimikkeistöä koskevia sääntöjä sen varmistamiseksi, että ne ovat ajan tasalla. Tutustu komiteaan yllä olevan sivuston kautta.
Yleiset nimikkeistösäännöt: Fissiohiivageenien nimet ilmaistaan yleensä kolmikirjaimisena, kursivoitu nimi numerolla ja plus villityypille (cdc19+; plus on ylikirjattava normaalissa tekstissä). Mutanteissa plus korvataan alleelimerkinnällä (cdc19-P1). Alleelien nimitykset vaihtelevat suuresti muodoltaan; osa on kirjaimia, osa numeroita, osa sekoituksia.
useimmat tutkijat ilmoittavat poistoja, joiden arvo on Δ(delta). Esimerkiksi suosikkigeenisi yfg1+: n häiriö ura4+: lla kirjoitetaan Δyfg1:: ura4+ asianmukaiseen kantataulukkoon, vaikka ihmiset käyttävät usein Δ yfg1 tai yfg1Δ lyhyttä kättä tekstissä. Viime aikoina suosituksi nimeksi on tullut yfg1Δ. Ilman lisäystä rakennetuille deleetioalleeleille jotkut käyttävät D-kirjaimella alkavaa alleelinimitystä; esimerkiksi ura4-D18 on ura4+: n deleetio. Et kuitenkaan voi olla varma, että alleelimerkinnän ”D” on aina deleetio, joten käytä varovaisuutta ja lue kirjallisuutta. Jotkut kannustavat voimakkaasti siihen, että deleetio-alleeleille annetaan yksilöllinen alleelin nimitys, esim.yfg1-D1::ura4+, mutta tämä ei ole tyypillistä. Useissa tapauksissa sama geeni on kuitenkin hajonnut eri laboratorioissa, ja fenotyypit vaihtelevat tarkan Konstruktion mukaan. Ilman yksilöllistä tunnistetta tietyn laboratorion alleelille tämä on johtanut huomattavaan sekaannukseen kirjallisuudessa.
:: (kaksoiskoloni) käytetään osoittamaan insertiota genomiin. Sen ei tarvitse vastata poistoa/häiriötä, esimerkiksi lokuksen merkitseminen integroimalla merkki myötävirtaan merkittäisiin yfg1+:: leu1 + tai yfg1+:: pAB123. Yleensä, mitä tulee ennen :: on lokus, ja sinun täytyy ilmoittaa, onko se villi tyyppi tai mutantti; mitä tulee jälkeen :: on mitä oli integroitu, ja sinun täytyy tunnistaa se samoin. Joissakin tapauksissa ihmiset käyttävät yhtä kaksoispistettä: osoittaakseen lisäystä ja kaksoispistettä :: osoittaakseen korvaavaa/häiriötä.
proteiinit on merkitty roomalaisella tekstillä. Vanhemmassa kirjallisuudessa tätä seurasi liitteenä oleva p (esim.Cdc19p). P on erityisen hyödyllinen ei-hiiva ihmisiä, jotka saattavat olla tuntemattomia yleissopimusten roman vs. kursiivi tyyppi, mutta se on pudonnut pois suosiosta. Vain vaikeuttaa elämää entisestään, orastava hiiva nimikkeistö on erilainen: villityyppisten geenien nimet ovat kursiivilla suuraakkosin (LEU2), mutanttien (ellei hallitseva) ovat pienaakkosilla (leu2-3) ja proteiinien nimet ovat roomalaisessa tekstissä (LEU2 tai Leu2).
