Microbiota respiratorio normale in salute e malattia

Le infezioni respiratorie gravi sono un rischio per tutti i pazienti ospedalizzati, ma sono particolarmente comuni nell’unità di terapia intensiva (ICU). I pazienti ricoverati in terapia intensiva hanno un rischio maggiore di sviluppare polmonite nosocomiale rispetto ai pazienti ricoverati in altri reparti dell’ospedale e i pazienti ventilati hanno un rischio 3-10 volte maggiore di sviluppare polmonite nosocomiale rispetto a quelli che non sono ventilati. Questo è in parte perché molti pazienti di terapia intensiva richiedono il supporto del ventilatore per aiutare con percorsi ostruiti o altre condizioni che impediscono loro di respirare da soli. La ventilazione consiste nel posizionare un tubo endotracheale lungo la trachea per fornire ossigeno direttamente ai polmoni, che è una procedura salvavita ma non senza rischi. Per molte ragioni, i pazienti ventilati meccanicamente sono particolarmente suscettibili allo sviluppo di polmonite. Infatti, la polmonite è la seconda infezione nosocomiale più comune che colpisce i pazienti critici in terapia intensiva.

Polmonite associata al ventilatore e ruolo della normale flora respiratoria

I pazienti sono al massimo a rischio di sviluppare polmonite associata al ventilatore (VAP) nelle prime 48 ore dopo l’inserimento di un tubo endotracheale. Il posizionamento del tubo interrompe la normale anatomia delle vie respiratorie e impedisce al paziente di deglutire, tossire o eliminare muco e altre secrezioni normalmente. Poiché queste secrezioni si accumulano nell’orofaringe, i batteri che vivono nel tratto respiratorio possono iniziare ad accumularsi lungo il tubo endotracheale. Se il paziente aspira questi batteri, possono causare infezioni nei polmoni.

Rappresentazione del posizionamento del tubo endotracheale in un paziente gravemente malato.
Rappresentazione del posizionamento del tubo endotracheale in un paziente gravemente malato.

Gli organismi che normalmente vivono all’interno del tratto respiratorio possono finire per essere gli stessi organismi che causano la polmonite in questi pazienti. Comprendere che un singolo organismo può essere un microbiota normale o un agente patogeno incoraggia il microbiologo e il clinico a considerare altri fattori chiave quando si effettua una diagnosi VAP come quali organismi costituiscono la normale flora respiratoria e ciò che rende alcuni membri del microbiota respiratorio più patogeni di altri.

Gli organismi commensali hanno il potenziale di causare danni

Come tutte le superfici cutanee e mucose umane, il tratto respiratorio è colonizzato da batteri commensali che proteggono l’ospite dalle malattie, aumentano i tassi di rinnovamento cellulare epiteliale e promuovono la produzione di immunoglobuline mucose. La difficoltà nella diagnosi della causa di VAP viene dal fatto che molti di questi organismi hanno il potenziale di causare la malattia. Gli organismi presenti colonizzano semplicemente il tubo endotracheale e le vie aeree circostanti senza causare danni o sono la causa dell’infezione? La tabella 1 elenca gli organismi più comunemente isolati dal tratto respiratorio e i ruoli che possono svolgere sia nella colonizzazione innocua che nella malattia.

Sito di Rilevamento Organismo/Significato
Orofaringe Rinofaringe e

Gruppo C o G Streptococchi

  • Più comunemente rappresenta la colonizzazione, ma può causare casi isolati e focolai di faringite sintomatica.

Streptococco di gruppo A

  • Colonizza fino al 20% dei bambini.
  • Meno comunemente: causa faringite o infezioni respiratorie localizzate.
  • La relazione tra la malattia invasiva da streptococco di gruppo A e la colonizzazione faringea non è chiara.

Streptococcus pneumoniae

  • Una vasta gamma (dal 6% al 100%) di neonati e bambini piccoli viene colonizzata.
  • Circa il 25% dei bambini tra i 3 mesi e i 4 anni di età sono colonizzati e il 5-10%% delle persone anziane e più giovani.
  • Può persistere per settimane o mesi in questo sito.
  • Crescente S. pneumoniae da una coltura dell’orofaringe / rinofaringe non ha alcun significato, ma circa il 15% dei bambini svilupperà infezioni cliniche entro un mese dall’acquisizione di un nuovo ceppo.
  • Un bambino che sviluppa un’infezione virale del tratto respiratorio superiore mentre è colonizzato può sviluppare otite media acuta o sinusite.

Haemophilus influenzae non tipizzabili e Moraxella catarrhalis

  • Una grande percentuale di neonati e bambini piccoli sono colonizzati.
  • La crescita di questi organismi da una coltura dell’orofaringe/rinofaringe non ha alcun significato, ma i bambini con infezioni respiratorie superiori possono sviluppare infezioni secondarie come otite media o sinusite se vengono colonizzati.

Neisseria meningitidis

  • 5 al 30% della popolazione è colonizzata, con la percentuale più alta che rappresenta adolescenti e giovani adulti.
  • Coltivare questo organismo da una coltura dell’orofaringe o del rinofaringe non ha alcun significato, ma la colonizzazione può portare a batteriemia, meningite o artrite settica.
Tratto respiratorio inferiore

Streptococcus pneumoniae

  • Contaminante comune del tratto respiratorio superiore (dove si tratta di un organismo colonizzatore), ma anche una causa comune di malattia del tratto respiratorio inferiore. Il significato della presenza di questo organismo nella cultura si baserà molto sul quadro clinico, su altri test diagnostici e sulla predominanza nella cultura.

Staphylococcus aureus

  • Circa un terzo degli adulti è colonizzato con S. aureus nelle loro vie respiratorie superiori. Questo organismo è una delle cause più comuni di VAP e la malattia grave con S. aureus è quasi sempre preceduta dalla colonizzazione.

Le specie non tipizzabili di Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis e Enterococcus

  • raramente causano infezioni respiratorie inferiori o VAP. Se vengono coltivati in coltura dal tratto respiratorio inferiore, è probabile che rappresentino la contaminazione dalla colonizzazione del tratto respiratorio superiore.

Enterobacteriaceae e bacilli Gram-negativi non fermenti

  • Questi organismi sono tra le cause più comuni di VAP.
  • Colonizzare il tratto respiratorio superiore nei bambini che sono stati in terapia intensiva o hanno ricevuto frequenti cicli di antibiotici. Questi possono diventare il nuovo “microbiota normale” dei bambini ventilati in terapia intensiva e la loro presenza in coltura potrebbe non sempre indicare l’infezione.
  • Il significato di questi organismi in coltura dipende fortemente dal quadro clinico, da altri test diagnostici e dalla predominanza in coltura.
Qualsiasi Vie Respiratorie Sito

streptococchi del gruppo Viridans, Nonhemolyic streptococchi, stafilococchi coagulasi-negativi, Parte Neisseria specie, specie Corynebacterium, Lactobacillus specie, Micrococcus specie, Stomatococcus specie e specie di Bacillus

  • Parte normale del tratto respiratorio superiore microbiota, e non sono associati con la malattia clinica.

Tabella 1. Gli organismi più comunemente isolati dal tratto respiratorio e il loro significato.

Molti patogeni respiratori vivono normalmente nell’ospite senza causare malattie. Identificare uno di questi organismi come causa di infezione deve essere fatto nel contesto di segni clinici e sintomi di polmonite*. Il trattamento di tutti gli organismi identificati dalle colture del tratto respiratorio può portare a un uso eccessivo di antibiotici e incoraggiare lo sviluppo di organismi resistenti agli antibiotici. Cosa rende questi batteri apparentemente normali così pericolosi, e come possono vivere all’interno degli esseri umani e non causare malattie la maggior parte del tempo, ma occasionalmente causare infezioni letali? È importante capire come alcune delle cause più comuni di polmonite passano da colonizzatori a patogeni opportunisti. Di seguito sono riportati i principali batteri 3 associati a VAP e i tratti che consentono loro di farlo.

Macchia di grammo di un campione respiratorio di un paziente senza polmonite
Macchia di grammo di un campione respiratorio di un paziente senza polmonite

Fonte: Foto per gentile concessione di A. Prinzi.

Streptococcus pneumoniae come agente patogeno del tratto respiratorio inferiore

Lo Streptococcus pneumoniae è un normale colonizzatore delle vie respiratorie, ma è la principale causa di mortalità per polmonite a livello globale. L’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS) stima che questo organismo sia responsabile dell’uccisione di mezzo milione di bambini in tutto il mondo ogni anno.
Tratto di virulenza: capsula polisaccaridica.

  • Aiuta il batterio a eludere le difese dell’ospite.
  • La capsula, che è caricata negativamente, consente al batterio di evitare di rimanere bloccato nelle mucose, raggiungere e attaccare alle cellule epiteliali.

Virulenza tratto: proteine di superficie (come ialuronato liasi)

  • Incoraggiare e promuovere attaccamento.
  • Promuovere la produzione di biofilm in modo che più organismi possano attaccarsi e proliferare.

Se colonizza S. gli organismi pneumoniae sono autorizzati a farsi strada nel tratto respiratorio inferiore, a seguito di disturbi anatomici come un tubo endotracheale, un’infezione virale primaria come l’influenza o l’aspirazione, i batteri usano una varietà di fattori patogeni per attaccarsi alle cellule alveolari e accendere una risposta infiammatoria dell’ospite, con conseguente polmonite.

Colonie di Mucoide S. pneumoniae su una piastra di agar del sangue. L'aspetto mucoide è dovuto alla produzione di capsule particolarmente abbondante in questo ceppo di S. pneumoniae.
Colonie di Mucoide S. pneumoniae su una piastra di agar del sangue. L’aspetto mucoide è dovuto alla produzione di capsule particolarmente abbondante in questo ceppo di S. pneumoniae.

Pseudomonas aeruginosa come Tratto Respiratorio Inferiore Patogeno

Pseudomonas aeruginosa, non è comunemente parte del microbiota delle vie respiratorie, ma può diventare un colonizzatore in pazienti che sono stati ricoverati in ospedale per un periodo di tempo prolungato. Questo vale anche per altre barre Gram-negative, tra cui gli Enterobacterales. In un paziente ricoverato in ospedale, in particolare un paziente intubato, non è sicuro presumere che la presenza di P. aeruginosa in una coltura respiratoria equivale automaticamente all’infezione. Detto questo, nei pazienti con VAP confermato, P. aeruginosa è la causa batterica più comune. Se P. aeruginosa è l’organismo predominante che cresce in una coltura aspirata tracheale da un paziente ventilato con sintomi di polmonite, è probabilmente l’agente patogeno causale.
L’effetto di P. aeruginosa su un paziente intubato sarà diverso a seconda del sierotipo:

  • Gli isolati con i sierotipi O6 e O11 colonizzano l’uomo più spesso di altri sierotipi, ma il 60% dei pazienti risolve le infezioni da VAP con questi sierotipi.
  • I sierotipi O1 e O2 sono meno comuni e sono associati a una maggiore mortalità.

La patogenicità di P. aeruginosa è molto complessa e l’organismo utilizza diversi meccanismi per aderire alle superfici viventi e non viventi. Le sue numerose proprietà di adesione consentono a P. aeruginosa di formare biofilm, in particolare su dispositivi medici; la formazione di biofilm su tubi endotracheali aumenta il rischio del paziente di acquisire VAP se l’organismo si sposta nei polmoni.

Staphylococcus aureus come agente patogeno del tratto respiratorio inferiore

Quasi un terzo degli adulti è colonizzato da Staphylococcus aureus nelle loro vie respiratorie. Mentre molte persone non svilupperanno mai complicazioni a causa della loro colonizzazione di S. aureus, gli adulti che sono colonizzati e intubati hanno un rischio 15 volte maggiore di sviluppare la polmonite di S. aureus rispetto a quelli che non sono stati colonizzati. Inoltre, S. aureus è responsabile di >20% dei casi di VAP, il 50% dei quali è causato da MRSA.
Tratto di virulenza: le proteine di superficie batteriche, in particolare la proteina A, sono essenziali affinché l’organismo possa causare mortalità correlata alla polmonite.
Mentre questi numeri sono spaventosi, è importante ricordare che una gran parte della popolazione è colonizzata con questo organismo e la sua presenza nella cultura non suggerisce immediatamente l’infezione.

Commensali respiratori come patogeni: tutto sommato

Le relazioni tra esseri umani e batteri sono immensamente complesse. Il microbiota respiratorio normale può svolgere un ruolo chiave nella salute umana, ma può anche svolgere un ruolo nelle gravi malattie respiratorie. Comprendere queste relazioni può aiutare la microbiologia clinica e la comunità delle malattie infettive a capire meglio come decifrare i risultati diagnostici quando si tratta di polmonite acquisita in ospedale.
* Come può un microbiologo clinico fare una diagnosi nel contesto di segni e sintomi clinici? Assicurati di prendere il prossimo articolo di questa serie che discuterà le sfide e i benefici della diagnostica della polmonite.

Quanto sopra rappresenta le opinioni dell’autore e non riflette necessariamente l’opinione dell’American Society for Microbiology.



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