al in het jaar 782 begon de verkoop van vis in het gebied, dankzij het koude grondwater dat beschikbaar was op het terrein, waardoor vis en ander vlees vers konden worden gehouden op een locatie dicht bij het Keizerlijk Paleis van Kyoto.In 1615 kreeg de plaats voor het eerst officieel toestemming van de regering van Bakufu om vis te verkopen, wat de eerste stap is om een gerenommeerde markt te worden.
in 1883, na de Meiji-Restauratie, werd door de sterke concurrentie tussen de vestigingen het aantal winkels teruggebracht tot slechts 7.
in 1911, een nieuwe vereniging die de markt promoot als plaats voor de verkoop van vis en schaal-en schelpdieren, zag de markt een hernieuwde vitaliteit.In 1927 werd de centrale Groothandelsmarkt van Kyoto geopend en verhuisden er veel winkels van de Nishiki-markt naar toe.
in 1928 bevorderde een nieuwe vereniging de opening van winkels met fruit, groenten, vlees en andere voedingsmiddelen. Dit markeert het punt waar de markt begon te worden bekend als “Kyoto’ s kitchen”.
in 1984 werd de huidige geplaveide vloer geïnstalleerd en in 1993 werd de huidige Arcade luifel geïnstalleerd.
in het jaar 2005 werd “Nishiki Market” geregistreerd als handelsmerk.