Naming a new gene? É uma boa ideia verificar no projecto genoma de pombe do centro de Sanger para ver se a sua designação genética já está tomada. Você também pode reservar um nome genético para um locus particular antes da publicação. Os investigadores são instados a usar o registo genético para reservar nomes, para propor alterações de nome, ou para contactar o GNC (Comité de nomenclatura genética). O GNC irá endereçar nomes duplicados, designações não-padrão, e outras questões desse tipo. Procederá igualmente à revisão das regras de nomenclatura, conforme necessário, a fim de assegurar a sua actualização. Acesse o Comitê através do site acima.
regras gerais de nomenclatura: os nomes dos genes da levedura de fissão são geralmente expressos em três letras, nome itálico seguido de um número, e um mais para o tipo selvagem (cdc19+; o mais deve ser superscriptado no texto normal). Em mutantes, O plus é substituído por uma designação de Alelo (cdc19-P1). As designações alelas variam muito em formato; algumas são letras, alguns números, algumas uma mistura.
a maioria dos investigadores indica supressões com Δ(delta). Por exemplo, uma interrupção de seu gene favorito yfg1+ com ura4+ é escrito Δyfg1::ura4+ em uma tabela de tensão adequada, embora as pessoas muitas vezes usam Δ yfg1 ou yfg1Δ como mão curta no texto. Recentemente, yfg1Δ tornou-se a designação preferida. Para alelos de deleção construídos sem inserção, alguns usam uma designação de Alelo começando com D; P.ex., ura4-D18 é uma deleção de ura4+. No entanto, você não pode ter certeza de que um” D ” em uma designação Alela é sempre uma exclusão, então use cuidado e leia a literatura. É fortemente encorajado por alguns, de que a eliminação de alelos de ser dado um único alelo de designação, por exemplo, yfg1-D1::ura4+, mas isso não é comum. No entanto, em vários casos, o mesmo gene foi interrompido em laboratórios diferentes, e os fenótipos variam de acordo com a construção precisa. Sem um identificador único para o alelo de um determinado laboratório, isso levou a uma considerável confusão na literatura.
o:: (cólon duplo) é usado para indicar uma inserção no genoma. Não precisa corresponder a uma supressão / ruptura, por exemplo, marcando um locus integrando um marcador A Jusante seria indicado yfg1+::leu1+ ou yfg1+::pAB123. Geralmente, o que vem antes do :: é o locus, e você precisa indicar se é tipo selvagem ou mutante; o que vem depois do :: é o que foi integrado, e você precisa identificá-lo também. Em alguns casos, as pessoas usam um único cólon: para indicar uma inserção, e um dois cólon:: para indicar uma substituição/ruptura.As proteínas são indicadas pelo texto romano. Na literatura mais antiga, isto foi seguido por um p anexado (eg, Cdc19p). O p é particularmente útil para pessoas não fermentadas que podem não estar familiarizadas com as convenções do tipo romano versus itálico, mas caiu em desuso. Para complicar ainda mais a vida, a nomenclatura de leveduras é diferente: os nomes dos genes do tipo selvagem estão em maiúsculas itálicas (LEU2), os mutantes (a menos que dominantes) estão em minúsculas (leu2-3) e os nomes das proteínas estão em texto romano (LEU2 ou Leu2).
