prezența Spaniei în zonă poate fi urmărită într-o așezare numită Santa Cruz de la Mar Peque Oqua, fondată în 1476. După atacurile berberilor, spaniolii au decis să se concentreze pe colonizarea altor zone din Africa de Nord și au abandonat Regiunea.
la mijlocul secolului al 19-lea, când puterile europene s-au uitat din nou la Africa pentru resurse, Spania și-a exprimat brusc interesul pentru cetatea medievală târzie pierdută pentru a revendica partea de sud a Marocului. Acest lucru a servit drept pretext pentru un scurt război cu Marocul în 1859.
teritoriul și principalul său oraș Sidi Ifni au fost cedate Spaniei de Sultanatul Marocului la 26 aprilie 1860, dar a existat puțin interes pentru această achiziție colonială până în 1934, când Guvernatorul General al Saharei spaniole și-a stabilit reședința. Aeroportul devenise o escală crucială pentru zborurile dintre continent și Insulele Canare, iar în 1938 a fost stabilită o rută comercială de către compania aeriană Iberia care leagă Sevilla, Larache, Sidi Ifni, Capul Juby și Gando în Canare.
până în 1952, Regiunea Ifni avea statutul de protectorat. În acest an, regiunea a devenit parte a Africii de Vest spaniole (entitate care a grupat coloniile din Sahara spaniolă și capul Juby).
după Războiul Ifni (1957), cea mai mare parte a teritoriului a devenit ocupată de facto de Morocco.In în 1958, colonia a fost transformată într-o provincie spaniolă pentru a preveni criticile Organizației Națiunilor Unite cu privire la continuarea colonizării.
în urma unui tratat semnat la 4 ianuarie și ratificat la 22 aprilie, Spania a returnat Oficial teritoriul Marocului la 30 iunie 1969.
