1700-luvun varhaiset klassiset sinfoniat valettiin alun perin kolmessa osassa (fast-slow-fast) italialaisen oopperan alkusoittojen jälkeen. Sitten, alkaen 1750-luvulla, se oli normaalia Saksassa ja Itävallassa sisällyttää minuet luoda muodossa fast-slow-minuet-fast. Prahan Sinfoniassa ei kuitenkaan ole minuettia, mikä olisi ollut tavattoman poikkeuksellista Wienissä 1780-luvun lopulla sävelletylle sinfonialle. Mozart itse, joka sävelsi paljon enemmän sinfonioita vanhanaikaisella fast-slow-fast-formaatilla kuin Haydn (johtuen läheisemmistä yhteyksistään Italiaan), ei koskaan aiemmin säveltänyt kolmiosaista sinfoniaa Wieniin, ei edes lapsena 1760-luvulla, jolloin kolmiosaiset sinfoniat olivat vielä yleisiä monissa osissa Eurooppaa. Daniel E. Freeman on esittänyt, että kolmiosainen formaatti olisi voitu valita keinoksi vedota Prahan musiikkiyleisöön. Ainoa prahalainen sinfonisti, jonka Mozart tunsi hyvin, oli Josef Mysliveček, joka oli läheinen työtoveri Mozartin suvussa vuosina 1770-78. Sattumoisin lähes kaikki Myslivečekin sinfoniat on valettu Italiassa suosimalla kolmiosaisella kuosilla, jossa hän pääasiassa työskenteli koko aikuisikänsä. Lopullinen selitys Prahan sinfoniaorkesterin kolmiosaiselle formaatille kuitenkin puuttuu.
Prahan Sinfoniassa soitetaan kaksi huilua, kaksi oboeta, kaksi fagottia, kaksi torvea, kaksi trumpettia, patarummut ja Jouset.
siinä on kolme osaa, joista jokainen on sonaattimuodossa:
- Adagio-Allegro, 4
4 - Andante G-duurissa, 6
8 - finaali (Presto), 2
4
ensimmäinen osa alkaa hitaalla johdatuksella (hän tekee tämän vain kahdessa muussa sinfoniassa, nro 36 ja nro 39). Tri Daniel E. Freeman on todennut, että se on luultavasti pisin ja hienostunein hidas johdanto, joka on kirjoitettu mitään suurta sinfoniaa varten siihen mennessä, kenties kompensoidakseen puuttuvan minuetin pituutta, jotta koko teos saataisiin lähemmäksi tavallisen neliosaisen sinfonian tavanomaista pituutta. Johdannossa väistyy liikkeen pääosa, jossa kuusi melodiaa kehitellään ja kerrataan hyvin kontrapunktisessa esimerkissä sonata-allegro-muodossa. Eräät ensimmäisen osan lauseet muistuttavat alkusoittoa to Die Zauberflöte. Allegro proper avautuu monimutkaisella tavalla” ensimmäisen teeman ” vaihdellessa toisen viulun (joka aloittaa sen) ja ensimmäisen viulun (joka lopettaa sen) välillä. Koko ensimmäisen osan ensimmäisestä molliosasta löytyvä musiikillinen materiaali on samanlaista kuin Mozartin Don Giovannin alkusoitossa. Lisäksi tämän osion orkesteritehosteet ovat samankaltaiset: tuulet ja patarummut kuuluttavat sointua jousilla soittaen tasaista rytmistä harmoniaa soinnun kanssa.
toisen osan rakenne on tyypillinen tältä aikakaudelta peräisin oleville Mozartin sinfonioille, joskin musiikki siirtyy molli-säveliin ristiriitaisten tunnelmien muodostamassa osassa. Se on G-duurin subdominanttiavaimessa.
kolmas osa on eloisa Presto, jossa huilulla on merkittävä rooli erityisesti kehitysosan päämelodian vastapainona. Tämä osa ” osoittaa Mozartin epätavallisella tuulella, lähempänä Beethovenin riehakkuutta kuin hänen tarkka makunsa tavallisesti salli hänen mennä.”Liikkeen molemmilla puoliskoilla on toistoja.